应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 理论与计算方法 » VMD及NAMD加水盒子
81/1返回列表
查看: 770  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

一时花开11

新虫 (正式写手)
已领完
VMD及NAMD加水盒子
领取红包 (小木虫手机app专属红包)

扫一扫，下载小木虫客户端

看NAMD手册加入水盒子的命令是
solvate ubq.psf ubq.pdb -t 5 -o ubq_wb。现在有一个问题是如何知道加入这个水环境后，具体的水数目是多少呢？如果我要具体的水数目（比如199），又该如何操作呢？麻烦各位虫友解答，感激不尽。

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2018-10-08 21:44:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鲁智深的皮

铁虫 (小有名气)
set wat [atomselect top water]
$wat num
可以得到所有水的原子数，除以3就是水分子数量

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2018-12-25 12:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
一个人的修行2楼
2018-10-08 21:44   回复  
一时花开11(金币+1): 谢谢参与
已获得1个金币 发自小木虫Android客户端
hdchina20103楼
2018-10-08 21:45   回复  
一时花开11(金币+5): 谢谢参与
已获得5个金币 发自小木虫IOS客户端
wlx1213wlx4楼
2018-10-08 21:47   回复  
一时花开11(金币+3): 谢谢参与
已获得3个金币 发自小木虫Android客户端
tzynew5楼
2018-10-08 21:47   回复  
一时花开11(金币+2): 谢谢参与
已获得2个金币 发自小木虫Android客户端
22985973736楼
2018-10-08 21:50   回复  
一时花开11(金币+4): 谢谢参与
已获得4个金币 发自小木虫Android客户端
jixiangbao7楼
2018-10-08 21:50   回复  
一时花开11(金币+5): 谢谢参与
已获得5个金币 发自小木虫IOS客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 一时花开11 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭