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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 根据序列设计完引物，跑完胶测序一对比不完全吻合怎么办
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xydlengyue

金虫 (正式写手)

[求助] 根据序列设计完引物，跑完胶测序一对比不完全吻合怎么办已有3人参与

按照NCBI上找的序列设计的，但是引物送来PCR之后结果无法完全吻合
原序列：
AAAATAATATAAAAAAATAATAAATTAATTTCTTTATATATCATTTAGTTAATGGCGATTCTATAAAAAATCACAGAAAAATTTGTTGGAAAAGTTAAAGGTTGTATCTGGGGTGCCGATAAACTTGTTGCCGGTGATTGACACCGTAAATGAATAGGCAAACTTTTATTTTATCGACTTGATTTTAAAGGAATCTAGCTATGGCACAAGTCATTAATACCAACTATCTATCCCTGGTAACTCAAAACAACCTGAACAAATCTCAGGGAACTTTAGGAAGTGCAATCGAGCGTCTGTCTTCTGGTCTACGTATCAACAGTGCAAAAGACGATGCAGCGGGTCAAGCAATTGCTAACCGTTTCACTTCAAACGTAAATGGTTTAACTCAAGCTTCACGTAATGCGAACGATGGTATCTCTATCGCTCAAACAACTGAAGGTGCATTAAACGAAATCAACAATAACTTACAACGTATCCGTGAGTTAACTGTTCAAGCGAAAAACGGTACTAACTCTAATTCAGATATCACTTCTATCCAAAACGAAGTGAAAGAACGTTTAGACGAAATCAACCGTATTTCTGAACAAACTCAGTTTAACGGCGTGAAAGTACTGAGCGGTGAGAAATCAGAAATGGTTATCCAAGTTGGTACTAACGATAATGAAACTATCAAATTTAACTTAGATAAAGTTGATAACGATACATTAGGTGTTGCTAGCGATAAACTGTTTGATGCTAAAACAGAGAAAAAAGGTGTTACAGAAGCAGGTGCTGCAATCGATGCGAAAGATATCGGCGTTGCTGGTGCAACTTCATACGATTCAGGTACAGTAAAAGAATATAAAGTAGATGGTGTTGTTTCTGCTGATAAAGTAATTTTCAATGATGGTACTAAAGATTACCTCGTAAATAAAAGCGATTTCGCACTGGAAGGTGCTGACAAAGCTAAATTTACTGGTGCTAAAACAACTGAATTTACAGCAGATGCAGGTAAAGACGTTAAAACTTTAAACGTTAAAGATGACGCTTTAGCAACTTTAGACAAAGCTATCAACACCATTGATGAAAGCCGTTCTAAATTAGGTGCGATTCAAAACCGTTTTGAATCTACTATCAACAACCTGAACAACACTGTTAACAACTTATCTGCTTCACGTAGCCGTATCTTAGATGCTGACTATGCAACAGAAGTTTCTAACATGAGCCGTGGTCAAATCTTGCAACAAGCGGGTACTTCAGTACTTGCTCAAGCAAACCAAGTACCACAAACTGTTCTGTCTCTGTTACGTTAATTCGTACCCTGACACAAAAGATACCTTTCTATATCAAAGGCCCTCATCTGAGGGTCTTTTTTGTCATTTTATTTTATATTTAAACTCACTCTGTTTTAGTTTATTTTTTTCTCTCCATCTATTTTTGTTTTTTCTGCTAGTCATTATCTCTTATAAATTAATTAATTGGCTTTTTTTACTATTTTCGCGACGCGAAAACA
设计的引物：5'  GGTTGTATCTGGGGTG  3'     F
                    5'  TCAGATGAGGGCCTTTG  3'   R


引物设计说实在刚接触，不是太懂，来个大佬指导一波，帮我找找问题

根据序列设计完引物，跑完胶测序一对比不完全吻合怎么办
对比图.png
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篮球与科研都很重要~
1楼2018-09-25 21:35:57
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zw破风

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你这个引物设计的就不对吧
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2018-09-27 11:05:03
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