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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】有高手帮忙分析一下这个分子的可能靶标么？
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后皇嘉树

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】有高手帮忙分析一下这个分子的可能靶标么？

课题做到半年，老板忽然要我分析所做药物的可能靶标，从没有做过分子模拟、预测或对接的东西，一点都没接触过，感觉快崩溃了。
向各位大侠求教了。
偶把分子结构贴上来，麻烦大家帮我看看。
如果可以的话，附近地区的，偶请客。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:18 ]
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看花开花落，心依旧。
1楼 2009-04-07 13:33:25
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ylj1089

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
后皇嘉树(金币+5,VIP+0):多谢啦! 4-7 20:33
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
检索pubmed，可以检索阿尔法羟基羧酸和邻二酚，看有没有相似的结构针对特定的靶标。
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2楼2009-04-07 15:25:56
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后皇嘉树

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by ylj1089 at 2009-4-7 15:25:
检索pubmed，可以检索阿尔法羟基羧酸和邻二酚，看有没有相似的结构针对特定的靶标。

用哪个部分找呢？
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看花开花落，心依旧。
3楼2009-04-07 20:34:46
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xiangyongwang08

木虫 (著名写手)
★ ★
后皇嘉树(金币+2,VIP+0):呵呵，感谢你的支持啦! 4-8 06:56
帮你顶了
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4楼2009-04-07 22:10:57
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
后皇嘉树(金币+3,VIP+0):多谢啦! 4-8 06:57
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
我看这个结构很不稳定。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2009-04-08 00:07:49
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后皇嘉树

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2009-4-8 00:07:
我看这个结构很不稳定。

是说它很容易变质么？
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看花开花落，心依旧。
6楼2009-04-08 06:58:06
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nkyx

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
后皇嘉树(金币+10,VIP+0):非常感谢你的建议！ 4-8 09:54
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 4-9 07:48
可以试一下上海药物所DDDC开发的靶标数据库。只要你的小分子坐标，输入后，就搜寻他们建好的靶标库。这个库用的是反对接的原理。通常我们所说的对接，是用一个靶标对一个小分子或者多个小分子；反对接就是用一个小分子去搜一个或者多个靶标。不过目前只限蛋白质靶标。
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7楼2009-04-08 09:17:28
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后皇嘉树

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by nkyx at 2009-4-8 09:17:
可以试一下上海药物所DDDC开发的靶标数据库。只要你的小分子坐标，输入后，就搜寻他们建好的靶标库。这个库用的是反对接的原理。通常我们所说的对接，是用一个靶标对一个小分子或者多个小分子；反对接就是用一个小 ...

这个数据库是开放的么？
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看花开花落，心依旧。
8楼2009-04-08 09:54:55
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nkyx

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
后皇嘉树(金币+5,VIP+0):谢谢！ 4-8 12:53
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 4-9 07:48
是免费的。
http://www.dddc.ac.cn/pdtd/index.php
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9楼2009-04-08 10:58:14
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xpyp

木虫 (小有名气)
治啥病的药物???
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10楼2009-04-08 12:19:53
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