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【求助】新手求助，MD细节问题
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给位能不能帮我解释下下面这段话，我实在是看不懂 关键是对我做优化和Dynamuics（NPT,NVT）过程中参数的设制有什么指导意义？ 模拟时应用两体有效势能近似、 最小镜像 准则等基本假设， 模拟过程中采用立方周期性边界条件 ， 位能截断采用球形截去法， 截断半径为半个盒子的边长， 截断距离之外 的粒子间相互作用 能采用长程校正法进行校正， 长程静电相互作用力采用 E w a l d加和法计算。 采用 S HA K E算法固定水分子的几何构形 ， 用蛙跳算法求解体系的运动方程。 |
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