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cxsky315

至尊木虫 (著名写手)

小木虫华南地区特派专员

[交流] 精修中怪事(已解决)

最近我得到一个晶体,含有苯环的对位硝基取代的配合物物,精修时出现一个问题,在定初结构时,我人为(按系统提示无法找出框架),采用无心空间群定下框架后,我把所有的C N O都定为了C原子,然后升为有心空间群,之后我进一步定下所有原子种类,但是在定硝基的时候就怪了,如果把硝基上的O定下(有心转化前定下O则根本不能进行空间群的有心转化),然后XL时就无法进行(提示如下图A2-1),当我把O改成C时,反而XL正常,F约1,R wR2 均比较小。难道我的结构出错??实在想不通,期待高人指点一二。
补充下: 我看了C1---N1键长明显偏离文献值了,我的图示中已经达到了1.5埃,书上数据只有1.21--1.22埃。我试了DFIX,但是没有丝毫效果。

[ Last edited by cxsky315 on 2009-4-3 at 00:31 ]
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Love is a lamp,while friendship is the shadow.When the lamp is off,you will find the shadow everywhere.Friend is who can give you streng that last.
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liutaone

木虫 (正式写手)



cxsky315(金币+1,VIP+0):3q^^再试。。。。 4-3 00:08
SFAC C H N O MN N
UNIT 62 140 48 26 14 5

格式如上,你加在最后吧,因为每种元素都有一个序号,按我上面的顺序C的序号就是1,Mn是5,N就是6. 从下面可以看出每种元素后面的序号都是一定的,所以你要注意对应。


         
MN8   5    0.199935    0.383011    0.105678    11.00000    0.03646    0.03312 =
         0.03070   -0.00188   -0.01139   -0.01018
C1    1    0.722935    0.166680    0.316681    11.00000    0.03735    0.03995 =
4楼2009-04-02 23:48:35
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liutaone

木虫 (正式写手)



cxsky315(金币+1,VIP+0):十分感谢,我试试 4-2 23:39
嗯,初步认为是你的SFAC里面没有O原子,所以忽然出现了一个O程序不认。所以在SFAC和UNIT里分别加上O和O的个数再试一下。
2楼2009-04-02 23:37:10
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cxsky315

至尊木虫 (著名写手)

小木虫华南地区特派专员

引用回帖:
Originally posted by liutaone at 2009-4-2 23:37:
嗯,初步认为是你的SFAC里面没有O原子,所以忽然出现了一个O程序不认。所以在SFAC和UNIT里分别加上O和O的个数再试一下。

我的。res里面确实没有O,呵呵..加的位置有限制么??我是如图加的,但是还是出现上面一样的错误提示,格式是什么样的啊??能详细点么??

[ Last edited by cxsky315 on 2009-4-2 at 23:48 ]
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3楼2009-04-02 23:42:20
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cxsky315

至尊木虫 (著名写手)

小木虫华南地区特派专员

原子后面的参数不知道啊
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5楼2009-04-02 23:54:01
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