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swordzj858至尊木虫 (著名写手)
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【求助】SYBYL有关命名的问题（2金币）
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请问各位：在SYBYL中“Build/Edit >>> Name Molecule”和“File >>> Save As ——Enter * as the file name” 两者有何不同，是否所有的分子必须都要进行“Build/Edit >>> Name Molecule”的操作？ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:12 ] |
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_steven
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“Build/Edit >>> Name Molecule” 是对当前分子命名，即在存储Mol2或SDF文件时分子的名称，“Save As”是存储分子的文件名称，如xxx.sdf,xxxx.mol2等。 比如你在Sybyl主界面中画了一个乙烷分子，默认的分子名称可能是Molecule1，你可以使用“Build/Edit >>> Name Molecule” 将其名称为“ethane”，然后“Save As” molecule.mol2，此时你打开molecule.mol2，在 不知道这样有没有说清楚。 |
4楼2009-06-02 21:00:20
snoopyzhao
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第一、在sybyl主界面里存在的分子或者是画好的分子，都要对分子命名，然后再保存的； 第二、楼主说的这两个选项是有先后顺序的，先“Build/Edit >>> Name Molecule”，讲分子命名，然后“File >>> Save As ——Enter * as the file name” 把这个分子保存。如果只做第一步，仅仅是给分子命了名，并未保存。 第三、“Build/Edit >>> Name Molecule”也不是必须的操作，但是一般情况下都应该进行这一步，因为系统默认的分子文件名字不直观，对我们以后的操作会误导，建议进行这一步。 |
5楼2009-07-13 11:37:04