应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】 动力学平衡问题
51/1返回列表
查看: 790  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dongdong3881

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】 动力学平衡问题

请帮忙看看这样的温度曲线可以判断体系稳定吗？
我用的是NVT,T=200K


[ Last edited by zdhlover on 2009-11-23 at 13:54 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
好好自己好好学习
1楼 2009-03-26 09:49:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alwens

铁杆木虫 (正式写手)

老木虫
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 3-26 14:56
太大，你体系多少个原子，用什么程序做的

和原子数的N3有关的。
赞一下(10人) 回复此楼
万里夕阳锦背高 翻身犹恨东洋小 太公怎钓？
4楼2009-03-26 10:15:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

dongdong3881

木虫 (正式写手)
是不是温度波动太大了？？
赞一下 回复此楼
好好自己好好学习
2楼2009-03-26 09:50:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdirac

木虫 (正式写手)
★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3Q! 3-26 14:56
波动是应该的,但是这个也太大了.
   程序里是不是个参数可以调啊!!
   例如什么 mass之类的.



  
  你看一下 nose-hoover 热浴的原理. 可能会有点帮助
  a molecular dynamics method for simulations in the canonical ensemble
           by shuichi nose
                   molecular physics       1984. vol.52,Vo,2,255-268

[ Last edited by superdirac on 2009-3-26 at 10:16 ]
赞一下(10人) 回复此楼
我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
3楼2009-03-26 10:09:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):3Q! 3-26 14:57
感觉温度波动比较大啊，既然是NVT就不该这样啊。。。

如果用Nose-Hoover热浴的话，温度可以控制得很好，几乎恒定不变。
赞一下(10人) 回复此楼
5楼2009-03-26 11:05:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭