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橙橙小沫

新虫 (初入文坛)

[求助] 异源表达总是得不到活性蛋白 是这段基因没有做下去的必要了吗 已有2人参与

请问 真核微生物里的一段产酶基因做异源表达,有可能真核原核都得不到活性蛋白吗?
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用户晓晓

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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渊博震天: 金币+3, 鼓励有价值的回帖 2018-07-12 16:34:41
首先答案肯定是否定的!

异源表达要得到具有活性的蛋白,影响条件还是很多的:

1,蛋白表达的氨基酸序列的准确性,跟你使用的载体或者物种有关,是否需要进行氨基酸密码子优化,有事也是很重要的事情。

2,即便是表达了完整的蛋白,蛋白是否能够正确的折叠组装同样是很重要的。

3,一些表观修饰,比如磷酸化,泛素化,乙酰化 可能是异源表达难以模拟的。

4,有些蛋白需要有辅助蛋白的作用,才能发挥功能。

这些都可能导致异源表达的蛋白没有酶活,不代表这个基因不重要。

祝试验顺利!
2楼2018-05-16 15:21:20
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maoniuniu

新虫 (小有名气)

如果可以,请提供更多的信息,大体描述一下你的表达序列设计方式、使用的表达体系、纯化的体系手段。
影响蛋白表达及活性的因素太多,只有排除了你自身实验设计及操作上的问题后,才能进一步判断这个蛋白究竟是什么情况
3楼2018-05-16 17:17:38
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橙橙小沫

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by maoniuniu at 2018-05-16 17:17:38
如果可以,请提供更多的信息,大体描述一下你的表达序列设计方式、使用的表达体系、纯化的体系手段。
影响蛋白表达及活性的因素太多,只有排除了你自身实验设计及操作上的问题后,才能进一步判断这个蛋白究竟是什么 ...

切了信号肽的序列 原核表达选择的是pet28a 感受态选择了BL21DE3没有蛋白表达,有大量包涵体,改用rosseta de3有蛋白表达,也存在包涵体,没有酶活。
还换过一个氨苄抗性的pet载体也是没有蛋白表达。
真核选用的是毕赤酵母GS115 ppic9k,电转之后菌落PCR验证转进去了,对照空载表达没蛋白,我的有蛋白,在61KDA左右,也是没活性。我师姐说有时候染菌了在那个分子量也会有调带,我就不是很确定到底是不是我的蛋白表达。同样的转化子第二批发酵的时候蛋白条带却没了……,也是很神奇的显现。不知道接下来该怎么做了,表达了都快一年了
4楼2018-05-21 08:19:26
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maoniuniu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
渊博震天: 金币+3, 鼓励有价值的回帖 2018-07-12 16:35:45
引用回帖:
4楼: Originally posted by 橙橙小沫 at 2018-05-21 08:19:26
切了信号肽的序列 原核表达选择的是pet28a 感受态选择了BL21DE3没有蛋白表达,有大量包涵体,改用rosseta de3有蛋白表达,也存在包涵体,没有酶活。
还换过一个氨苄抗性的pet载体也是没有蛋白表达。
真核选用的是 ...

从你叙述看,目前主要问题是在表达上

原核表达的话,都在包涵体,不溶,你的蛋白多大呢?低温诱导、高或低水平OD值以及低浓度IPTG都试过吗?换Rosseta的话一般不会促溶,这个菌株可以提高表达水平。如果你还想做原核,可以试TransB的菌株,我用过全式金的,有助于形成二硫键,对于含二硫键的蛋白有促溶效果,促折叠

原核表达如果愿意再花些精力,还可以尝试与分子伴侣体系共表达,有多种不同的分子伴侣可以选择,这个体系Takara有卖,你可以去官网看一下说明书,再决定

促折叠的话,标签也很重要,你用的全是pET系列的,可以尝试GST或者MBP标签,这两种标签分子量大,但是可以促进折叠,促溶,另外对于MBP标签,还可以选用pMAL-p5x载体,蛋白会被分泌到周质空间,也是为了促进蛋白折叠

如果都不行,可以考虑对蛋白进行分段表达,不清楚你下游是用来做什么,这个酶有多大,结构是否清楚,可以尝试只表达酶活区域,分子小了,会更易于表达

再不济,如果你愿意,可以尝试变性复性,这个一般难度都比较大,条件摸索起来很费劲,不建议,但也是一种方法

酵母表达的话,一般用的都是营养缺陷型的筛选标记吧,一般不容易染菌,但是你的有时有,有时没有的,只能自己多检查自己的体系和方法了,是用诱导型的吗?有些情况下也要考虑是否你的外源蛋白对宿主细胞有毒性,当然,肯定要避免杂菌污染,这个没法分析

如果这些表达体系经过严格操作验证无法获得正确的酶,只能考虑比如哺乳动物表达体系,293,或者昆虫细胞一类的表达体系,我用昆虫-杆状病毒的表达体系,如果有问题,可以再讨论

你的酶是哪种类型?测定酶活的方法以及底物选择都正确吗?这些也要保证无问题

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5楼2018-05-22 16:09:41
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A8610587

新虫 (小有名气)

包涵体可以试试低温表达,使可溶表达变多,只要可溶表达量还可以,就可以往下做了呀

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6楼2018-07-12 13:22:49
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