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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 实验技术 » 做了一个有参的植物转录组，但是转录组所有基因库中找不到目的基因。
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还重名啊

铜虫 (小有名气)

[交流] 做了一个有参的植物转录组，但是转录组所有基因库中找不到目的基因。 已有1人参与

做了一个有参的植物转录组，但是转录组所有基因库（不光是差异基因库）中找不到一个目的基因。用全序列比对不到，这种情况正常嘛？发文章可以解释吗
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1楼 2018-05-15 21:10:04
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还重名啊

铜虫 (小有名气)
是有一个基因组中有的基因，在转录组里找不到，其他的感兴趣基因可以找到。即使不表达也应该FPKM显示0，但是这个基因就是找不到
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2楼2018-05-15 21:11:55
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在水壹方

新虫 (小有名气)
★
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正常，那就是没有检测到或者该基因没有表达

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3楼2018-05-16 22:58:37
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还重名啊

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-05-16 22:58:37
正常，那就是没有检测到或者该基因没有表达

即使不表达也应该FPKM显示0，但是这个基因就是找不到
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4楼2018-05-23 23:57:19
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在水壹方

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 还重名啊 at 2018-05-23 23:57:19
即使不表达也应该FPKM显示0，但是这个基因就是找不到...

那就是没有比对上

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5楼2018-05-24 10:00:57
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还重名啊

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 在水壹方 at 2018-05-24 10:00:57
那就是没有比对上
...

请问发了论文能解释不
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6楼2018-05-27 23:57:59
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