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hu持剑人

新虫 (初入文坛)

[求助] 涡虫基因blast 低于多少可以用来作为判断新种的依据 已有1人参与

涡虫基因blast 低于多少可以用来作为判断新种的依据,国内外有文章讲这个吗?小白求教。
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wenwen4599

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我是做其他无脊椎动物的,涡虫这个不清楚。就我自己做的类群来说,物种间的遗传变异不好说,你可以看看有关barcoding的文章。一般是在种群间的遗传变异和种间遗传变异程度之间会有一个gap,只要在这个gap以下的就可以认为是同一个物种。然而也会有一些物种出现例外,种群间遗传变异和种间变异的程度有重叠。
建议:1.有文献支持的前提下将文献中提到的种间差异作为你分析的参考值。
         2.没有参考的前提下可以在网上搜集同属不同物种的序列,自己做分析,估算不同物种间遗传差异,给出一个参考范围。
         3.没有序列的情况下,只能自己多找几个能够确定是不同物种的个体,最好是同属的。自己测序后,比对分析。
2楼2018-07-04 09:55:19
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