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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » [请教]siesta赝势与基组
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quantum999

金虫 (著名写手)

[交流] [请教]siesta赝势与基组

用了siesta主页提供的abinit的赝势和系统生成的DZP、PBE泛函做了个tio2的分子模型的简单计算，比g03的b3lyp/lanl2dz的键长大约0.5A

调整其他的参数对结果没有多大影响


可见，要让siesta产生可行度较好的结果，赝势和基组非常重要。

但怎么优化它们呢？
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1楼 2009-03-20 11:13:54
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢 3-22 22:05
赝势和基组不能优化，只能选择。
siesta可以结合自己的应用自己建立适合自己研究体系的赝势。
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储氢家族欢迎储氢研究者！
2楼2009-03-20 11:24:59
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quantum999

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zxzj05 at 2009-3-20 11:24:
赝势和基组不能优化，只能选择。
siesta可以结合自己的应用自己建立适合自己研究体系的赝势。

多谢！
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3楼2009-03-22 16:21:27
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hongjw04

铜虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:20
这个好像可以优化吧，不是经常见到optimized basis sets么？ 赝势生成的时候，改变不同的rc，是不是也算优化？
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4楼2009-07-11 07:42:18
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quantum999

金虫 (著名写手)
★
yjr(金币+1,VIP+0):谢谢！！ 8-15 12:56
siesta主页上有针对特殊体系的基组。
前段时间做了个练习，siesta的优化的结构和gaussian差别较大，不知该如何提高精度，收敛精度已经提高了，可能是赝势和基组了。

发愁啊！
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5楼2009-07-11 20:46:30
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wutianhuan

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
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fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:21
这么麻烦啊，换个软件呗，不用siesta不就行了么
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6楼2009-07-12 11:10:56
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quantum999

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 7-13 03:24
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q！ ^_^ 7-14 17:25
引用回帖:
Originally posted by wutianhuan at 2009-7-12 11:10:
这么麻烦啊，换个软件呗，不用siesta不就行了么

体系大，看上了它的linear scaling
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7楼2009-07-12 22:52:40
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fuzp

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:21
改变rc，好像产生的赝势是一样的啊。除了开始的那几行参数。
引用回帖:
Originally posted by hongjw04 at 2009-7-11 07:42:
这个好像可以优化吧，不是经常见到optimized basis sets么？ 赝势生成的时候，改变不同的rc，是不是也算优化？

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8楼2009-08-15 00:56:05
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hchfox

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 8-16 17:21
别看Siesta号称O(N)，但效率还是挺低的，特别是并行效率不高，还有赝势和基组够你测试和优化的了。。。末路代码，放弃吧。。。
引用回帖:
Originally posted by quantum999 at 2009-7-12 22:52:

体系大，看上了它的linear scaling

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9楼2009-08-15 01:08:46
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hongjw04

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjr(金币+2,VIP+0):谢谢评论 8-15 10:20
你改变的rc是在Basis set block里面修改的吗？那个是优化Basis set 的。
你要优化赝势，要编辑*.inp 文件，改变里面的rc即可。
使用说明可以看  Siesta安装目录/Pseudo/atom/Docs/  下有。
或者去这里下载：

http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/atom.pdf

Good luck!
引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-8-15 00:56:
改变rc，好像产生的赝势是一样的啊。除了开始的那几行参数。
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10楼2009-08-15 02:06:11
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