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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » [请教]siesta赝势与基组
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hongjw04

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjr(金币+1,VIP+0):谢谢！！ 8-15 18:57
你试过Siesta吗？
你能用其他的第一原理软件在小型工作站上计算上千个原子的系统吗？

用平面波基组是很方便，但如果计算薄膜，纳米线，量子点等要考虑真空层的系统， Siesta的基组还是有很大的优势。

至于赝势，用每种第一原理软件计算前你都得验证吧？难道你拿过来就直接用？
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2009-8-15 01:08:
别看Siesta号称O(N)，但效率还是挺低的，特别是并行效率不高，还有赝势和基组够你测试和优化的了。。。末路代码，放弃吧。。。
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11楼2009-08-15 02:11:16
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fuzp

铁杆木虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjr(金币+1,VIP+0):谢谢！！ 8-15 18:57
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2009-8-15 01:08:
别看Siesta号称O(N)，但效率还是挺低的，特别是并行效率不高，还有赝势和基组够你测试和优化的了。。。末路代码，放弃吧。。。


请问一下对于大体系，有没有什么好些的代码？Materials Studio里自带的ONETEP也号称O(N)，不过没有测试过。
http://www.hpc2n.umu.se/projects/computing/  的luo yi他们的code也号称能算很大的体系。
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12楼2009-08-15 02:50:50
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hchfox

木虫 (正式写手)
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fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:21
那你坚持用两三年试试，保持不换，再说吧，呵。。。
引用回帖:
Originally posted by hongjw04 at 2009-8-15 02:11:
你试过Siesta吗？
你能用其他的第一原理软件在小型工作站上计算上千个原子的系统吗？

用平面波基组是很方便，但如果计算薄膜，纳米线，量子点等要考虑真空层的系统， Siesta的基组还是有很大的优势。

至于 ...

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13楼2009-08-15 08:53:08
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hchfox

木虫 (正式写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 8-16 17:21
没干过大体系的计算，OPENMX开源跟SIESTA类似，据说也能考虑较大的体系，但赝势质量，基组选择。。。
引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-8-15 02:50:


请问一下对于大体系，有没有什么好些的代码？Materials Studio里自带的ONETEP也号称O(N)，不过没有测试过。
http://www.hpc2n.umu.se/projects/computing/  的luo yi他们的code也号称能算很大的体 ...

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14楼2009-08-15 08:59:01
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hongjw04

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
已经用了两年多了......
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2009-8-15 08:53:
那你坚持用两三年试试，保持不换，再说吧，呵。。。
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15楼2009-08-15 15:33:14
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redskywei

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2009-8-15 01:08:
别看Siesta号称O(N)，但效率还是挺低的，特别是并行效率不高，还有赝势和基组够你测试和优化的了。。。末路代码，放弃吧。。。


天哪，俺们还打算好好使用这个软件的，基组是公共的标准基组，应该只存在选择问题吧，也要优化？并行问题是俺们最头疼的，还没搞定。

[ Last edited by redskywei on 2009-9-21 at 12:54 ]
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坠入无边的网~~
16楼2009-09-21 12:52:58
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