24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1774  |  回复: 15
当前主题已经存档。

quantum999

金虫 (著名写手)

[交流] [请教]siesta赝势与基组

用了siesta主页提供的abinit的赝势和系统生成的DZP、PBE泛函做了个tio2的分子模型的简单计算,比g03的b3lyp/lanl2dz的键长大约0.5A

调整其他的参数对结果没有多大影响


可见,要让siesta产生可行度较好的结果,赝势和基组非常重要。

但怎么优化它们呢?

回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxzj05

荣誉版主 (著名写手)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢 3-22 22:05
赝势和基组不能优化,只能选择。
siesta可以结合自己的应用自己建立适合自己研究体系的赝势。
储氢家族欢迎储氢研究者!
2楼2009-03-20 11:24:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantum999

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zxzj05 at 2009-3-20 11:24:
赝势和基组不能优化,只能选择。
siesta可以结合自己的应用自己建立适合自己研究体系的赝势。

多谢!
3楼2009-03-22 16:21:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongjw04

铜虫 (小有名气)


fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:20
这个好像可以优化吧,不是经常见到optimized basis sets么? 赝势生成的时候,改变不同的rc,是不是也算优化?
4楼2009-07-11 07:42:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantum999

金虫 (著名写手)


yjr(金币+1,VIP+0):谢谢!! 8-15 12:56
siesta主页上有针对特殊体系的基组。
前段时间做了个练习,siesta的优化的结构和gaussian差别较大,不知该如何提高精度,收敛精度已经提高了,可能是赝势和基组了。

发愁啊!

5楼2009-07-11 20:46:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wutianhuan

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:21
这么麻烦啊,换个软件呗,不用siesta不就行了么
6楼2009-07-12 11:10:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantum999

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 7-13 03:24
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q! ^_^ 7-14 17:25
引用回帖:
Originally posted by wutianhuan at 2009-7-12 11:10:
这么麻烦啊,换个软件呗,不用siesta不就行了么

体系大,看上了它的linear scaling
7楼2009-07-12 22:52:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuzp

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流 8-16 17:21
改变rc,好像产生的赝势是一样的啊。除了开始的那几行参数。
引用回帖:
Originally posted by hongjw04 at 2009-7-11 07:42:
这个好像可以优化吧,不是经常见到optimized basis sets么? 赝势生成的时候,改变不同的rc,是不是也算优化?

8楼2009-08-15 00:56:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hchfox

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 8-16 17:21
别看Siesta号称O(N),但效率还是挺低的,特别是并行效率不高,还有赝势和基组够你测试和优化的了。。。末路代码,放弃吧。。。
引用回帖:
Originally posted by quantum999 at 2009-7-12 22:52:

体系大,看上了它的linear scaling

9楼2009-08-15 01:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongjw04

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjr(金币+2,VIP+0):谢谢评论 8-15 10:20
你改变的rc是在Basis set block里面修改的吗?那个是优化Basis set 的。
你要优化赝势,要编辑*.inp 文件,改变里面的rc即可。
使用说明可以看  Siesta安装目录/Pseudo/atom/Docs/  下有。
或者去这里下载:

http://fisica.ehu.es/ag/siesta-extra/atom.pdf

Good luck!
引用回帖:
Originally posted by fuzp at 2009-8-15 00:56:
改变rc,好像产生的赝势是一样的啊。除了开始的那几行参数。


10楼2009-08-15 02:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 quantum999 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 288求调剂 +6 代fish 2026-04-09 6/300 2026-04-09 13:41 by 544594351
[考研] 0703总分331求调剂 +18 ZY-05 2026-04-04 22/1100 2026-04-09 09:09 by 哦哦123
[考研] 调剂 +16 2261744733 2026-04-08 16/800 2026-04-09 07:58 by Sammy2
[考研] 085404,334分,求调剂 +5 sunjie8888 2026-04-08 8/400 2026-04-09 07:26 by sunjie8888
[考研] 求调剂 +9 月@163.com 2026-04-07 11/550 2026-04-08 14:48 by qlm5820
[考研] 281求调剂 +10 椰子蘑菇 2026-04-06 10/500 2026-04-08 11:43 by zzucheup
[考研] 301求调剂 +10 细胞相关蛋白 2026-04-03 10/500 2026-04-08 10:36 by tjzhao
[考研] 263分B区求调剂 +6 李nihao 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:38 by 南开小綦
[考研] 344求调剂 +11 魏子per 2026-04-07 11/550 2026-04-07 23:01 by JourneyLucky
[考研] 机械调剂 +3 zzzbcb 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:19 by hemengdong
[考研] 一志愿西电085401求调剂 +4 sunw1306 2026-04-07 4/200 2026-04-07 16:40 by 啵啵啵0119
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 085600调剂 +4 1amJJ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:53 by hemengdong
[考研] 考研调剂 +4 zybz冲冲冲 2026-04-03 6/300 2026-04-04 13:08 by zybz冲冲冲
[考研] 387求调剂 +4 爱吃片豆土 2026-04-03 5/250 2026-04-04 08:10 by 岸上的一条鱼
[考研] 求调剂 +4 15064154688 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:07 by zrongyan
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +9 哇呼哼呼哼 2026-04-02 9/450 2026-04-03 12:05 by 1753564080
信息提示
请填处理意见