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kshdd

金虫 (著名写手)

[求助] 请问大神有什么可行的方法来确定细菌和真菌的总菌数,样品为景观河水 已有1人参与

小弟的样品为景观河水,想做细菌和真菌的可培养菌数占总菌数的比例,请问大神有什么可行的方法来确定细菌和真菌的总菌数?
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kshdd

金虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-04-18 08:18:32
总菌数这个表述太牵强了,不可培养菌怎么计数啊。PCR你可以试试定量16s,但是没有其他内参基因,这个也只能半定量。计数肯定是做不了的...

细菌有的基因组会有几个16S拷贝,真菌基因组会有几十到几千的18S拷贝数,所以qPCR的方法会夸大其数值;目前针对细菌的话,可以用死活菌染色进行总菌计数;但是针对真菌,我还没有找到合适的方法
9楼2018-04-18 08:36:21
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

你查找一下真菌是否有什么通用引物,细菌的话,可以通过16S通用引物,使用qPCR来进行16S拷贝数定量
2楼2018-04-17 13:56:29
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kshdd

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xp198766 at 2018-04-17 13:56:29
你查找一下真菌是否有什么通用引物,细菌的话,可以通过16S通用引物,使用qPCR来进行16S拷贝数定量

好的,谢谢大神的建议
3楼2018-04-17 14:54:10
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
3M的菌落总数,大肠菌群纸片,采了水样,梯度稀释,每个稀释度都做3个纸片
4楼2018-04-17 16:17:43
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