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分子对接 已有5人参与
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我的毕业课题是治疗某疾病的天然产物的活性成分计算机虚拟筛选,用到了DS和autodock软件。我现在用DS初筛之后,再用autodock打开靶点蛋白,处理过后,晶格选择能包住靶点蛋白活性部位,然后就开始对接了,初筛结束得到一共七百多个,目前对接了三四百个吧,保留了最低自由结合能小于-7的配体小分子,再用pymol查看靶点和筛选出来的配体的结合情况,发现打开了好多分子与靶点蛋白都没有氢键相连,这样的话,等到下一步进行ADMET筛选岂不很有可能筛不到东西。这是正常现象?还是,我的对接位置选择不对?还是有其他的可能性?大神们你们觉得呢? 发自小木虫Android客户端 |
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10楼2018-04-20 18:10:00
wavingsea9911
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