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kongkong0223

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么确定ORF是否完整?需要跑race么? 已有1人参与

我用同源比对从基因组数据库里搜到了目的序列(atg开头,taa结尾),克隆测序后与其他物种的同源序列比对,结果显示我的序列结构域完整,这能否说明我的orf是完整的?需要跑5'race么?有taa结尾,3'race是不是就不用跑了?望大侠指点~

发自小木虫Android客户端
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bio转录组

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果是ATG开头,TAA结束,我觉得没必要再跑RACE,而且你的结构域完整,你可以比对一下其他物种,一般基因长度不会差别很大。如果你要得到全长,或者后期需要基因全长序列,那就跑5,3
生活活生生累死
2楼2018-03-31 19:04:13
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