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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 怎么确定ORF是否完整？需要跑race么？
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kongkong0223

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么确定ORF是否完整？需要跑race么？ 已有1人参与

我用同源比对从基因组数据库里搜到了目的序列(atg开头，taa结尾)，克隆测序后与其他物种的同源序列比对，结果显示我的序列结构域完整，这能否说明我的orf是完整的？需要跑5'race么？有taa结尾，3'race是不是就不用跑了？望大侠指点～

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1楼 2018-03-31 18:13:32
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bio转录组

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果是ATG开头，TAA结束，我觉得没必要再跑RACE，而且你的结构域完整，你可以比对一下其他物种，一般基因长度不会差别很大。如果你要得到全长，或者后期需要基因全长序列，那就跑5,3
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生活活生生累死
2楼2018-03-31 19:04:13
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