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15623507725

新虫 (初入文坛)

[求助] Gibson连接和T4连接酶连接总是把不成功已有1人参与

目前在构建一个载体,用了两种方法:一个是Gibson连接,将骨架双酶切切开,然后将与骨架带有同源臂的片段用Gibson酶连接,然后再转化,菌落PCR验证出来的条带和我的目的条带总是不同,送去测序也不对;后来改用在连接片段前后加上酶切位点和保护碱基,转化出来的板一个菌落都没有。将片段送去测序也没有发现什么问题,感受态也没问题,这个实验反反复复做了快两个月了,就是没有进展。哪位大神能够给点思路,我号继续往下做。谢谢啦!@天使托
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渊博震天

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Yeast Display

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模板和目的基因浓度高不高?

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2楼2018-03-19 15:28:50
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新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-03-19 15:28:50
模板和目的基因浓度高不高?

不太高,在做T4连接的时候,骨架浓度只有10ng/ul,片段浓度是37ng/ul,骨架和片段比做了1:3和1:5两种体系,转化后就是不长。还有就是我双酶切后可以直接用Gibson连吗?
3楼2018-03-19 15:56:09
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

双酶切后尽量纯化一下子吧,浓度高的话连着会高效

发自小木虫Android客户端
4楼2018-03-19 16:08:24
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15623507725

新虫 (初入文坛)

纯化了的,过夜酶切后都有做纯化。找了好多原因就是找不到问题的关键所在。

发自小木虫IOS客户端
5楼2018-03-19 16:13:49
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先,Gibson连接是不依赖于限制性酶切位点的克隆方法,具有5->3外切酶活性的酶能将线性化的载体和插入片段相同的同源臂消化(chew back)产生相同的黏性末端(长度一般15-40nt),再用T4 DNA连接酶连起来。既然能用双酶切做克隆,那肯定首选酶切连接。酶切的作用也是产生相同的黏性末端。
2019更好更棒!
6楼2018-03-19 21:33:28
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15623507725

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by GRUBBY_WU at 2018-03-19 21:33:28
首先,Gibson连接是不依赖于限制性酶切位点的克隆方法,具有5->3外切酶活性的酶能将线性化的载体和插入片段相同的同源臂消化(chew back)产生相同的黏性末端(长度一般15-40nt),再用T4 DNA连接酶连起来。 ...

现在已经用T4连接酶连接了,可就是连不上。不知道问题在哪里。

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7楼2018-03-20 12:18:54
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猪妹妹May

铁虫 (初入文坛)

请问后来有解决Gibson连接效率的问题吗?
我的质粒重组必须要用Gibson,但是Gibson涂得板子都长不出来,连接效率很低。。
找不到问题所在。
8楼2018-11-30 19:48:21
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xinxinjin

银虫 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 猪妹妹May at 2018-11-30 19:48:21
请问后来有解决Gibson连接效率的问题吗?
我的质粒重组必须要用Gibson,但是Gibson涂得板子都长不出来,连接效率很低。。
找不到问题所在。

你好,我以前都用T4连接酶,现在想用Gibson连接,载体9k,目的基因5k,这个连接 如何?

发自小木虫Android客户端
9楼2019-04-04 15:15:28
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Mary Jane

新虫 (初入文坛)

想请问一下您现在解决了吗
10楼2022-02-10 16:06:55
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