24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1083  |  回复: 3

fuyiwy

新虫 (初入文坛)

[求助] ncbi提交序列后出现的问题,求解答!!!

请问NCBI提交序列后,收到了GenBank员工的回信,主要内容就是下面这段话,请站里面的大神帮忙指点哈这个要怎么处理,到底是什么原因?应该怎么处理后再提交?谢谢路过的各位!!!
All of the protein coding sequences in files 41398.sqn and 45367.sqn
contain internal stop codons, reading frame shifts (insertions/deletions
based on BLAST similarity search results and/or an alignment), and/or
have translations that show little or no similarity to other proteins
in the database:
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

karisq33

铜虫 (小有名气)

不是编码区序列,你提交的材料可能是标记了编码区,但是翻译过来有终止密码子等等,就是你提交的不是编码区却写了编码区

发自小木虫IOS客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2018-01-29 13:47:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuyiwy

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by karisq33 at 2018-01-29 13:47:36
不是编码区序列,你提交的材料可能是标记了编码区,但是翻译过来有终止密码子等等,就是你提交的不是编码区却写了编码区

因为我是测了转录组后设计的单/低拷贝核基因引物  然后扩增的序列  可能是扩增以后包含了基因间隔区。那请问可以用什么方法将间隔区找出来呢?
3楼2018-01-29 19:55:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

karisq33

铜虫 (小有名气)

blast找到同源或相似序列,比不上的就是间隔区,但是回复你的邮件里写的是没有blast到相似蛋白,你可以用核苷酸序列 blast

发自小木虫IOS客户端
4楼2018-01-29 20:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fuyiwy 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 同样的基金本子,换个专家直接从C变A! +3 国自然国社科中 2026-05-19 3/150 2026-05-19 08:50 by Equinoxhua
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +8 1234567wang 2026-05-17 10/500 2026-05-18 18:52 by zzahkj
[基金申请] 今年审到国自然15份,谈谈感受 +16 国自然国社科中 2026-05-17 16/800 2026-05-18 14:58 by gy116024
[硕博家园] 考博自荐 +5 科研狗111 2026-05-13 6/300 2026-05-18 11:22 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 重磅!青年科学基金项目(C类)资助增幅预计超过50% +7 水和泥不是水泥 2026-05-13 10/500 2026-05-18 07:50 by 水和泥不是水泥
[文学芳草园] 半夜喝咖啡 +3 myrtle 2026-05-15 5/250 2026-05-18 01:03 by 小沈2018
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 19:47 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 l7k6xnh0yc 2026-05-14 7/350 2026-05-17 19:42 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 xx7gd5zq4e 2026-05-15 6/300 2026-05-17 19:36 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:11 by 11n4dfd8yn
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-17 07:31 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 8/400 2026-05-17 07:26 by 11n4dfd8yn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cjf4bx70cj 2026-05-14 7/350 2026-05-17 06:55 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-17 01:25 by ue3ir18jc3
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:35 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:25 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-16 17:45 by j6b2pdz07o
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[论文投稿] 求助大佬sci投稿哪个好中 +3 江沅188 2026-05-12 4/200 2026-05-13 14:35 by 江沅188
信息提示
请填处理意见