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[资源]转载Genbank 数据库的使用
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序 应该说，大三分子实验的时候，就使用过genebank。可是下次再用，总是有点手生，时间久了是一个原因。于是萌生出这样一个念头，把每次用的过程记录下来，方便下次查询。在这里，希望各位数据库使用高手，多跟帖丰富这一主题。谢谢。 概述 Genebank数据库是一个分子数据全面、搜索功能非常好的一个数据库，另一方面，由于数据提交比较容易，缺乏严格的审核，数据的准确性和标准性不如其他的数据库。所以使用时学会分辨良莠。 microsatellite序列的搜索 以欧洲赤松（Pinus sylvestris）为例 上Genebank网站http://www.ncbi.nlm.nih.govl在“Search”栏：数据库选择“Nucleotide”（如下图），搜索内容选择“Microsatellite Pinus Sylvestris”，选择“Go”。  l结果中分成三个数据库：Core Nucleotide, EST (Expressed Sequence Tags), GSS (Genome Survey Sequence)。选择存在记录的数据库，点击进入。 在显示结果中选择物种为Pinus Sylvestris的记录。点击进入。 l显示结果 注：Access Number很重要，是某个序列片断在Genebank中的唯一地址名。另外在发表文章时，用其注明序列的出处。 如果有疑问可以从此处直接链接：http://cless.bnu.edu.cn/bbs/viewthread.php?tid=131 [ Last edited by 美丽魔鬼 on 2009-8-31 at 21:26 ] |
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4楼2009-08-20 08:50:08
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没有Genebank 数据库。只有GenBank数据库。我在论坛上提醒过多次了，但还是有很多人犯这种低级错误。。。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=699604&fpage=0&view=old&highlight=&page=1 [ Last edited by nnxqwei on 2009-8-22 at 20:06 ] |
5楼2009-08-22 20:04:59
