24小时热门版块排行榜    

查看: 743  |  回复: 5
【奖励】 本帖被评价2次,作者美丽魔鬼增加金币 1.25
当前主题已经存档。

美丽魔鬼

木虫 (正式写手)


[资源] [资源]转载Genbank 数据库的使用


应该说,大三分子实验的时候,就使用过genebank。可是下次再用,总是有点手生,时间久了是一个原因。于是萌生出这样一个念头,把每次用的过程记录下来,方便下次查询。在这里,希望各位数据库使用高手,多跟帖丰富这一主题。谢谢。


概述
Genebank数据库是一个分子数据全面、搜索功能非常好的一个数据库,另一方面,由于数据提交比较容易,缺乏严格的审核,数据的准确性和标准性不如其他的数据库。所以使用时学会分辨良莠。
microsatellite序列的搜索
以欧洲赤松(Pinus sylvestris)为例

上Genebank网站http://www.ncbi.nlm.nih.govl在“Search”栏:数据库选择“Nucleotide”(如下图),搜索内容选择“Microsatellite Pinus Sylvestris”,选择“Go”。




l结果中分成三个数据库:Core Nucleotide, EST (Expressed Sequence Tags), GSS (Genome Survey Sequence)。选择存在记录的数据库,点击进入。


在显示结果中选择物种为Pinus Sylvestris的记录。点击进入。



l显示结果


注:Access Number很重要,是某个序列片断在Genebank中的唯一地址名。另外在发表文章时,用其注明序列的出处。
如果有疑问可以从此处直接链接:http://cless.bnu.edu.cn/bbs/viewthread.php?tid=131

[ Last edited by 美丽魔鬼 on 2009-8-31 at 21:26 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

honglanbai

木虫 (正式写手)


★ 一星级,一般

看不了图
3楼2009-08-19 23:44:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

骚人追月

金虫 (小有名气)


好东西帮你顶一下,给几个金币吧!
4楼2009-08-20 08:50:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


没有Genebank 数据库。只有GenBank数据库。我在论坛上提醒过多次了,但还是有很多人犯这种低级错误。。。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=699604&fpage=0&view=old&highlight=&page=1

[ Last edited by nnxqwei on 2009-8-22 at 20:06 ]
5楼2009-08-22 20:04:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

美丽魔鬼

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by nnxqwei at 2009-8-22 20:04:
没有Genebank 数据库。只有GenBank数据库。我在论坛上提醒过多次了,但还是有很多人犯这种低级错误。。。
[url]http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=699604&fpage=0&view=old&highlight=& ...

非常感谢!
6楼2009-08-31 21:27:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2009-03-05 20:04   回复  
 
相关版块跳转 我要订阅楼主 美丽魔鬼 的主题更新
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085602 289分求调剂 +3 WWW西西弗斯 2026-03-24 3/150 2026-03-24 14:26 by JourneyLucky
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
信息提示
请填处理意见