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美丽魔鬼

木虫 (正式写手)


[资源] [资源]转载Genbank 数据库的使用


应该说,大三分子实验的时候,就使用过genebank。可是下次再用,总是有点手生,时间久了是一个原因。于是萌生出这样一个念头,把每次用的过程记录下来,方便下次查询。在这里,希望各位数据库使用高手,多跟帖丰富这一主题。谢谢。


概述
Genebank数据库是一个分子数据全面、搜索功能非常好的一个数据库,另一方面,由于数据提交比较容易,缺乏严格的审核,数据的准确性和标准性不如其他的数据库。所以使用时学会分辨良莠。
microsatellite序列的搜索
以欧洲赤松(Pinus sylvestris)为例

上Genebank网站http://www.ncbi.nlm.nih.govl在“Search”栏:数据库选择“Nucleotide”(如下图),搜索内容选择“Microsatellite Pinus Sylvestris”,选择“Go”。




l结果中分成三个数据库:Core Nucleotide, EST (Expressed Sequence Tags), GSS (Genome Survey Sequence)。选择存在记录的数据库,点击进入。


在显示结果中选择物种为Pinus Sylvestris的记录。点击进入。



l显示结果


注:Access Number很重要,是某个序列片断在Genebank中的唯一地址名。另外在发表文章时,用其注明序列的出处。
如果有疑问可以从此处直接链接:http://cless.bnu.edu.cn/bbs/viewthread.php?tid=131

[ Last edited by 美丽魔鬼 on 2009-8-31 at 21:26 ]
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


没有Genebank 数据库。只有GenBank数据库。我在论坛上提醒过多次了,但还是有很多人犯这种低级错误。。。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=699604&fpage=0&view=old&highlight=&page=1

[ Last edited by nnxqwei on 2009-8-22 at 20:06 ]
5楼2009-08-22 20:04:59
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骚人追月

金虫 (小有名气)


好东西帮你顶一下,给几个金币吧!
4楼2009-08-20 08:50:08
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美丽魔鬼

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by nnxqwei at 2009-8-22 20:04:
没有Genebank 数据库。只有GenBank数据库。我在论坛上提醒过多次了,但还是有很多人犯这种低级错误。。。
[url]http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=699604&fpage=0&view=old&highlight=& ...

非常感谢!
6楼2009-08-31 21:27:18
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