| 查看: 1729 | 回复: 8 | |||
[交流]
关于vina对接的问题，希望大家能帮我解决一下这个疑问，谢谢 已有8人参与
|
| 使用vina对接后，将受体-配体复合物导入到ligplot中观察，发现配体受到多个氢键和疏水作用，构象结合情况很好，可是vina结果的得分却比较差（-5.4左右），比别的没有氢键作用的还要高不少，是什么原因呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
22408 调剂材料
已经有6人回复
-
285求调剂
已经有12人回复
-
求调剂
已经有6人回复
-
085600材料与化工301分求调剂院校
已经有19人回复
-
277工科求调剂
已经有11人回复
-
277求调剂 数一104分
已经有13人回复
-
304求调剂
已经有10人回复
-
336求调剂，一志愿中科大
已经有6人回复
-
071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂
已经有3人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有19人回复
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
没研究vina的打分函数是怎样的。但不是看起来interaction多的就一定好。首先多不等于强，可能都是比较弱的。其次小分子构象高能的话，是penalty，与受体有clash的话，是penalty。还有，不排除有没有显示出来的非经典interaction。最后，打分函数也不一定准，做个参考。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2018-01-23 19:57:48
花生花灭
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1515.6
- 散金: 100
- 红花: 1
- 帖子: 561
- 在线: 88.7小时
- 虫号: 4699301
- 注册: 2016-05-17
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
3楼2018-12-14 15:46:21
zmcwangyang
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 5924.7
- 散金: 10
- 红花: 10
- 帖子: 1093
- 在线: 77.9小时
- 虫号: 15216698
- 注册: 2019-05-29
- 性别: GG
- 专业: 临床药理
4楼2019-12-09 22:00:48
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
5楼2019-12-31 16:11:05
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2020-01-02 17:14:53
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2020-01-04 11:09:50
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
8楼2020-01-06 16:49:29
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2020-01-08 16:54:00
