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关于vina对接的问题,希望大家能帮我解决一下这个疑问,谢谢 已有8人参与
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| 使用vina对接后,将受体-配体复合物导入到ligplot中观察,发现配体受到多个氢键和疏水作用,构象结合情况很好,可是vina结果的得分却比较差(-5.4左右),比别的没有氢键作用的还要高不少,是什么原因呢? |
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hclwonder
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没研究vina的打分函数是怎样的。但不是看起来interaction多的就一定好。首先多不等于强,可能都是比较弱的。其次小分子构象高能的话,是penalty,与受体有clash的话,是penalty。还有,不排除有没有显示出来的非经典interaction。最后,打分函数也不一定准,做个参考。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2018-01-23 19:57:48
花生花灭
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3楼2018-12-14 15:46:21
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4楼2019-12-09 22:00:48
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5楼2019-12-31 16:11:05
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6楼2020-01-02 17:14:53
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7楼2020-01-04 11:09:50
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8楼2020-01-06 16:49:29
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9楼2020-01-08 16:54:00












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