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汕头大学海洋科学接受调剂
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issp-hao

银虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学模拟一个数据点要独立跑几次? 已有2人参与

最近用分子动力学模拟方法投了篇文章,回来修改意见说,文章中没有说明一个数据点独立模拟的次数,想请问各位前辈,你们的分子动力学模拟的文章一个数据点都独立跑几次,看文献中一般都介绍先平衡多少步,然后产出阶段多少步,也没提到平衡和产出重复跑几次啊。这条意见应该怎么回复,还有你们都独立跑几次对于一个数据点,求建议。

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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个要具体问题具体分析。跑一次100纳秒和跑十次每次10纳秒对于有些问题是等价的。审稿人提问的关键是:你能否对你的计算结果给出一个误差估计?这才是最重要的。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2018-01-15 06:51:33
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liao廖

金虫 (正式写手)

木虫

没有太大意义。分子动力学模拟的数据不同于实验测试数据会有测量误差,结果本身就是统计力学数据的叠加。如果不是体系不同和改变运行条件的话,多次跑的数据差异不会太大。

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走自己的路,让更多的人跟着不至于无路可走。
2楼2018-01-12 17:17:39
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匿名

用户注销 (著名写手)


本帖仅楼主可见
3楼2018-01-12 19:24:13
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liao廖 at 2018-01-12 17:17:39
没有太大意义。分子动力学模拟的数据不同于实验测试数据会有测量误差,结果本身就是统计力学数据的叠加。如果不是体系不同和改变运行条件的话,多次跑的数据差异不会太大。
...

md本身有混沌效应 就算一样的参数跑 也不能重复的

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4楼2018-01-12 23:05:38
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