24小时热门版块排行榜    

查看: 1818  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

issp-hao

银虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学模拟一个数据点要独立跑几次? 已有2人参与

最近用分子动力学模拟方法投了篇文章,回来修改意见说,文章中没有说明一个数据点独立模拟的次数,想请问各位前辈,你们的分子动力学模拟的文章一个数据点都独立跑几次,看文献中一般都介绍先平衡多少步,然后产出阶段多少步,也没提到平衡和产出重复跑几次啊。这条意见应该怎么回复,还有你们都独立跑几次对于一个数据点,求建议。

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个要具体问题具体分析。跑一次100纳秒和跑十次每次10纳秒对于有些问题是等价的。审稿人提问的关键是:你能否对你的计算结果给出一个误差估计?这才是最重要的。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2018-01-15 06:51:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

liao廖

金虫 (正式写手)

木虫

没有太大意义。分子动力学模拟的数据不同于实验测试数据会有测量误差,结果本身就是统计力学数据的叠加。如果不是体系不同和改变运行条件的话,多次跑的数据差异不会太大。

发自小木虫Android客户端
走自己的路,让更多的人跟着不至于无路可走。
2楼2018-01-12 17:17:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (著名写手)


本帖仅楼主可见
3楼2018-01-12 19:24:13
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

awaken2013

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liao廖 at 2018-01-12 17:17:39
没有太大意义。分子动力学模拟的数据不同于实验测试数据会有测量误差,结果本身就是统计力学数据的叠加。如果不是体系不同和改变运行条件的话,多次跑的数据差异不会太大。
...

md本身有混沌效应 就算一样的参数跑 也不能重复的

发自小木虫IOS客户端
4楼2018-01-12 23:05:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 10/500 2026-11-15 02:15 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 9/450 2026-11-15 02:04 by xSrQNSSjcgoX
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-15 00:35 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-14 22:39 by Equinoxhua
[考博] 27博士 +6 锦鲤送福至 2026-11-10 6/300 2026-11-14 21:23 by xupeii
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-13 11:13 by Equinoxhua
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-13 11:11 by Equinoxhua
[考博] 27博士申请 +5 白白白ly 2026-11-09 5/250 2026-11-13 05:01 by wlf1982
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:48 by ECLTXnJnRSXf
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 5/250 2026-11-12 11:14 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 11/550 2026-11-12 09:57 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:46 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:43 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 5/250 2026-11-12 08:15 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 07:09 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:03 by TgvkbZZl9tqB
信息提示
请填处理意见