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michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)

[交流] 落后的分子生物学分析手段

在国内的时候其他学科的人都认为分子生物学的手段是很先进的,很多其他学科的人想利用分子生物学的手段解决些问题,而作分子生物学的人也有那种优越感,认为是很先进的技术。其实仔细想想,分子生物学和化学物理学比,分析手段落后太多了。分子生物学落后的分析手段是阻碍分子生物学发展的绊脚石。

      有人说分子生物学数据造假的多是因为数据容易造假。跑个胶就能放到文章里面去发表,搞化学的人都很不屑,说着图案太容易造假了,这种手段在上个世界化学领域就已经淘汰了,现在发表文章都要更先进的手段来检测这个东西。

     分子生物现在做核酸作蛋白最主要的检测手段就是跑胶,其实那东西太不可靠。我看过一个实验室的探讨一个蛋白5'端 self inhibition的例子,他们就研究这个机理,在酵母 arabidopsis,删除不同的区域,又和同家族的基因什么的共同表达,发了4篇JBC和plant physiology。我说你费这么大劲,不如直接来个蛋白结构的实在,转来转去,猜来猜去的,到最后的结论还都是推断出来的。这就是很好的一个技术限制学科发展的例子。

     其实生物化学和分子生物学完全是不同的两个学科领域,在国内经常把他们放在一起来说。来这之后发现作分子的理解做生化的很费劲。生化虽然也表达,克隆,但是他们的主要目的是在体外分析某个蛋白的作用机理,和分子在体内看某个蛋白的功能完全是不同的概念。生化的手段就先进些,分子的手段由于是在体内,只能依靠看表型和生理指标这类的数据。

     在国外很多作分子的已经体会到了,他们开始借助物理和化学的手段来解决分子生物学的问题,但是在中国大部分做分子的人还是存在那种万般皆下品唯有分子高的想法。
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漆腥瞅宠

禁虫 (正式写手)

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2楼2009-03-02 08:17:17
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cuixiongwei8848

木虫 (正式写手)

,认同。
3楼2009-03-02 08:18:34
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

其实做实验现在我们都不会只盯着分子marker这些了
比如做肿瘤的,先从cell line,或者癌灶癌旁上面把握到现象
然后就加一些干扰因素看表型,再看分子标记有无改变
然后再返回来看一些其他的生理变化
最后肯定要从分子到细胞到组织切片甚至到in vivo的实验
其实,比如说做周期吧,就光弄几个cyclin,或者rb、e2f之类的分子
没什么意思,还得回归整体性的讨论
比如做个流式,BrdU,MTT之类的综合起来看
回归一个整体性的讨论
现在看到很多文章就甚至只做了个免疫组化,或者MTT,就说什么东西有什么作用了……很搞笑,中文文献尤多这种垃圾
4楼2009-03-02 09:11:52
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)


国内很多人不知道生化分子的区别。瞎说一气。
5楼2009-03-02 09:37:07
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jzhe961

木虫 (正式写手)

也并非国内人不知生物化学和分子生物学的区别,只是国内学术氛围比较浮躁。生物化学重点在于某个生化过程的分析,也涉及到生物大分子的结构、功能等。分子生物学则围绕着中心法则,强调生物分子的遗传表达和调控等。事实上也没有谁先进,谁落后之说,只是研究的重点不同而已。多数人只是将分子生物学的一些方法如看做是分子生物学的全部是不正确的,除非有更简洁、准确的新方法才值得推崇,否则方法就仅成为一种手段。国内的高校,在培养学生时就是急功近利,学分子,基本理论不扎实,只是学习了一种技术,而这种操作还是在protocol的指导下的。比如好多学习分子生物学的同仁都要接触到生物信息学的东东,但大家有几个人能真正理解相关软件设计的原理和方法呢,就是以这葫芦画瓢,这样我们最后就感觉的这个专业有太多限制。生物科学是一个层级结构非常强的学科,做实验发文章的时候我们多思考一下,我们的努力是在解决什么问题,或对一个科学问题的解决有什么帮助。这样我们文章的价值和质量肯定会上去。时下,学风不好,各位达人虽然不在其位不能禁之,忍能助乎。
6楼2009-03-03 05:47:21
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veronica5129

铜虫 (初入文坛)

有点危机感了,我觉得分子生物学是国外永旧的工具,而我们只是拿它天天机械的干活,不只能否做出漂亮的成果
性格决定命运
7楼2009-03-03 17:50:48
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lauren180

木虫 (著名写手)

小木虫挖井人

那一个学科研究精了,都了不得,而且科学没有过时这一说吧
细推物理须行乐。
8楼2009-03-03 20:17:06
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michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by jzhe961 at 2009-3-3 05:47:
也并非国内人不知生物化学和分子生物学的区别,只是国内学术氛围比较浮躁。生物化学重点在于某个生化过程的分析,也涉及到生物大分子的结构、功能等。分子生物学则围绕着中心法则,强调生物分子的遗传表达和调控等 ...

阐述的相当精辟啊,现在国内大部分作分子的都是打一枪换一个地方,做个芯片,找点上调下调基因,拿过来作研究,很少有哪个实验室专门做某个家族的基因,对这个家族进行系统分析比较的。在做植物方向,可能大部分作分子的PI都是从育种,生理,组培方向转过来的,他们缺少利用先进手段的想法。

另外生化应该不仅仅是围绕生化过程的分析,很多生化的研究对象也有围绕中心法则的。比如研究DNA复制过程的那些酶什么的,不过这个在国内研究的比较少了,拿不到课题。但生化总体是研究大分子的功能,其实体外的研究更多些,分子体内的更多些。但是体内是个复杂的环境,有时候只能间接的通过某些表型或者生理指标来阐明问题。但是咱们看的大部分分子生物学的检测手段是什么呢?跑胶。这个是分子生物学术造假的根源。
9楼2009-03-04 01:03:32
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