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thug

新虫 (小有名气)

[求助] 大气颗粒物真菌DNA提取问题,试剂盒还是手提 已有2人参与

请问有没有前辈们知道提取大气中的DNA什么方法提取的更多?我们打算研究大气中真菌的种群分布特征,想用高通量测序的方法,可是DNA提取成了一个难点,我提取的面积得有100多平方厘米了,采的又是TSP,可是用MPMobio 试剂盒提取的浓度还不到10ng/μl。求指教!感激不尽!

@天使托 发自小木虫Android客户端
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by thug at 2017-12-24 18:32:33
请问您提取过吗?我问过测序公司,他们说最低含量要大于10才能做PCR的,我看文献中他们提取的也都大于10,不知道问题出在了哪里
...

测序公司用的是通用16s的多重引物组,其实10以下完全可以做了,你让他们风险扩增吧。平时的qPCR那个样品要求要10ng的哦。有很多都做不到,如果扩一次不够,可以要求扩2次的,后续的分析都一样
7楼2017-12-25 09:55:41
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

本来DNA含量就很低,而且很多都是碎片呀

发自小木虫Android客户端
2楼2017-12-24 18:05:21
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thug

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-12-24 18:05:21
本来DNA含量就很低,而且很多都是碎片呀

请问您提取过吗?我问过测序公司,他们说最低含量要大于10才能做PCR的,我看文献中他们提取的也都大于10,不知道问题出在了哪里

发自小木虫Android客户端
3楼2017-12-24 18:32:33
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)


4楼2017-12-24 19:01:53
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