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tjia

木虫 (小有名气)

[求助] 表面吸附的建模问题 已有1人参与

大家好,初入表面,刚学会表面计算,又要开始吸附、扩散的计算了,先开始建模就有很多的疑问:
1、slab的对称性问题,我算表面能的时候知道有两种方法:对称表面的计算量大点,但准确;非对称要加偶极修正。由于是新手,对偶极矩修正参数没有把控,所以选择了对称表面,以8层来说我固定了中间两层优化两边的3层。但现在要做吸附了,看文献上好像没人用对称的表面,都是固定下面几层,优化上面的表面。那固定的这几层就用块体优化后的参数?(比如说就切到我之前固定的那两层)那不吸附分子的这个终端就是任意的?这样跟吸附气体的表面端就不一样,是不是要加偶极修正?参数要测试吗?
2、优化的问题:以采用之前提到的5层slab为例,固定下面两层,然后优化上面三层以及吸附上的分子?还是应该比之前的表面能计算再多优化几层?
3、自旋极化:在论坛里看到一些老师的回复,说是只有有未满电子就应该考虑自旋极化,那我的理解是例如表面是非化学计量比、或者考虑缺陷了的话就会有不成对电子?吸附的分子比如H这种也是不满壳层的,是不是都要加自旋极化?还是应该把吸附的分子与表面一块来考虑电子占据情况?一旦对吸附的表面需要考虑自旋极化,那为了统一、能量可比(比如计算吸附能)应该所有计算(即使吸附前的完美表面)都应该打开自旋极化ISPIN=2去计算?
感谢回复,以后可能还有很多问题请教大家。
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星丹飞叶

新虫 (小有名气)

你好!我想问一下计算表面能是不固定slab吗?
5楼2018-03-20 21:13:31
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HAN_G

新虫 (初入文坛)

前两个问题,吸附一般只考虑能量差值,所以吸附前后参数一致即可。第三个问题,主要是自选对称性问题,对称则可以不设。

发自小木虫IOS客户端
紫荆显微-自营球差电镜-专精电子显微学
2楼2017-12-21 19:05:44
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tjia

木虫 (小有名气)

感谢回复,那slab模型是不是要满足化学计量比?对称性怎么选?如果满足化学计量比,那有的这能用非对称的表面,那在垂直于表面的方向就不对称?
3楼2017-12-22 09:43:19
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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
tjia: 金币+20, 有帮助 2018-01-19 09:55:00
个人浅见:
1、slab的对称性问题,我算表面能的时候知道有两种方法:对称表面的计算量大点,但准确;非对称要加偶极修正。由于是新手,对偶极矩修正参数没有把控,所以选择了对称表面,以8层来说我固定了中间两层优化两边的3层。但现在要做吸附了,看文献上好像没人用对称的表面,都是固定下面几层,优化上面的表面。那固定的这几层就用块体优化后的参数?(比如说就切到我之前固定的那两层)那不吸附分子的这个终端就是任意的?这样跟吸附气体的表面端就不一样,是不是要加偶极修正?参数要测试吗?
我个人认为,偶极矫正是有必要的,但是影响一般不是太大,参数没什么要测试的吧,一共就那几个参数,设置上就可以了

2、优化的问题:以采用之前提到的5层slab为例,固定下面两层,然后优化上面三层以及吸附上的分子?还是应该比之前的表面能计算再多优化几层?
我感觉固定下面两层,优化上三层和分子,已经可以了吧

3、自旋极化:在论坛里看到一些老师的回复,说是只有有未满电子就应该考虑自旋极化,那我的理解是例如表面是非化学计量比、或者考虑缺陷了的话就会有不成对电子?吸附的分子比如H这种也是不满壳层的,是不是都要加自旋极化?还是应该把吸附的分子与表面一块来考虑电子占据情况?一旦对吸附的表面需要考虑自旋极化,那为了统一、能量可比(比如计算吸附能)应该所有计算(即使吸附前的完美表面)都应该打开自旋极化ISPIN=2去计算?
感谢回复,以后可能还有很多问题请教大家。
做分子或者原子吸附,我一般都开自旋极化,这是个很微妙的问题,需要经验
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
4楼2017-12-22 20:32:50
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