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晶体解析绝对构型判断 已有3人参与
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各位大神，我们最近做了一个单晶衍射，做完之后解析出来的构型是S型，但是根据反应机理推测是R构型，我们确认反应原料没有问题，反应也没有问题，根据现有证据我们很确定应该是R构型，所以对这个单晶衍射给出的S构型结果比较怀疑，但是我对单晶衍射这一块也不懂，以下是这个单晶衍射的数据，做单晶衍射的人说化合物绝对结构参数一般。由于化合物结晶单元原子个数非常多，非氢原子将近180个。解析很困难。因此解析后期外界溶剂分子进行了squeeze处理。请大神指点一下，有没有可能是单晶衍射给出的结论不对？这个结果对我们非常重要，谢谢！ Table 1. Crystal data and structure refinement for T. Identification code T Empirical formula C30 H28 F N6 O2 Formula weight 523.58 Temperature 100(2) K Wavelength 1.54178 Å Crystal system Monoclinic Space group P21 Unit cell dimensions a = 10.7497(4) Å = 90°. b = 20.6670(8) Å = 101.176(2)°. c = 27.7242(12) Å = 90°. Volume 6042.5(4) Å3 Z 8 Density (calculated) 1.151 Mg/m3 Absorption coefficient 0.643 mm-1 F(000) 2200 Crystal size 0.160 x 0.120 x 0.100 mm3 Theta range for data collection 1.624 to 65.753°. Index ranges -11<=h<=11, -23<=k<=24, -32<=l<=31 Reflections collected 18764 Independent reflections 18764 [R(int) = 0.0862] Completeness to theta = 65.753° 97.0 % Absorption correction None Refinement method Full-matrix least-squares on F2 Data / restraints / parameters 18764 / 170 / 1404 Goodness-of-fit on F2 1.699 Final R indices [I>2sigma(I)] R1 = 0.1473, wR2 = 0.3676 R indices (all data) R1 = 0.1607, wR2 = 0.3908 Absolute structure parameter 0.17(19) Extinction coefficient n/a Largest diff. peak and hole 0.836 and -0.791 e.Å-3 |
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5楼2017-12-15 09:42:33
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