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第六日786

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】使用何种软件模拟蛋白质?

各位达人,我要模拟一个蛋白质晶体内部蛋白质分子与水的存在状态,请问使用何种软件合适?要注意哪些方面?

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-24 at 13:06 ]
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
gromacs,namd 都是在蛋白质模拟领域大量使用的免费分子动力学软件。amber 也可以。可以到http://www.mdbbs.org/bbs.php 看看。
insightII 也有人在用,据说售价要百万大洋,我没有用过。
其他的模拟工具是鸡肋。
5楼2009-03-01 12:43:15
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