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Jameweike

银虫 (初入文坛)

[交流] 悬赏30个金币 设计一个实验

从蛋白质出发克隆这个蛋白质的编码基因,写出详细的实验步骤,各位大侠要是能提供可行  详细的方案  我愿意送其金币30个
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boouy

银虫 (正式写手)

因不同物种而论。通常从生物信息分析开始,查找可能的核酸信息,然后利用引物(包括可能的简并位点)扩增,得到至少部分核酸的准确信息后,可进一步通过RACE等方式来分离全长基因。
2楼2009-02-27 07:58:29
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icicle_me

铜虫 (初入文坛)

是不是可以通过底物诱导使其大量表达后,纯化目的蛋白,然后进行氨基酸测序,根据序列,设计简并引物,再扩增目的基因
或者采用建库筛选的方法也是可行的,不过要看你的蛋白侧活方法是不是适合了
3楼2009-02-27 12:54:05
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Ella14

银虫 (小有名气)

你到CNKI里去找点硕博士论文,这些很详细。
4楼2009-02-27 23:52:56
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wmjiang

银虫 (小有名气)

同意先对protein表达测序,然后通过生物信息学的方法设计简并引物,扩增测序
5楼2009-03-04 20:27:54
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1081612

铜虫 (小有名气)

首先要看是那种物种  在要去数据库中去查  (要看数据中有不有这种蛋白)找出序列 在设计引物 再PCR
6楼2009-03-04 21:06:26
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winter_gates

金虫 (正式写手)

生命过客

二楼的比较对,这种实验是要自己去查文献和书来自己思考的,最好不要依赖别人,那样你自己学到的太少,而且会得到很多错误的经验。相应的教科书有很多,建议楼主先看看比较广泛介绍的书,在找具体相关领域的看。不要随便相信别人。
比如3楼说底物诱导表达,这个是基本上不可能实现的吧,你都不知道该蛋白质是什么有什么性质什么作用,怎么可能去诱导?
从生物体中直接提取某种天然蛋白的难度之大、复杂程度之高,没有具体实践很难明白。当然运气好除外。

我不是搞这个的,但是多少上课的时候听到过一些,多少给楼主说说吧,但是实际情况要实际分析,不能僵硬的去套模式。
1st 首先搞清楚你为什么去研究这个蛋白,这个蛋白相应的研究状况如何,它上下游的蛋白有哪些,有哪些蛋白与它相互作用,那些蛋白有可能调节它,它最可能参与的生物学过程。
2ed 参照你搜索到的资料的情况,上该物种的基因组数据库(多数的研究对象都有基因组数据库了)或者相近物种的数据库,查询该蛋白可能的相近蛋白的序列。BLAST你的目的蛋白(这里存在相似度高低的问题)。如果能找到最好,找到就可以直接PCR扩增,克隆表达。如果找不到,或者结果不能确定,那么转向第三步。
3rd 分离你的目的蛋白。这里方法很多,比如双向电泳、层析纯化、FISH实验等等。但是该过程是非常复杂的。分离出该蛋白后,可以打质谱测序,当然你只能拿到N端或者C端的小部分序列。那么走到这一步,如果难道的雪列是正确的,你已经是幸运儿了。
4th EST walking或者如2楼所讲RACE技术寻找或者测得全序列。这个我没有深入研究过,你要另请高人。到此,楼主的要求已经基本完成。剩下的就是鉴定该基因是否就是你的目的蛋白。这个也是一个满复杂的过程,因为视蛋白来源不同,验证方法太多,不好一一列举。
其实这应该是真正的研究开始,楼主要求的仅仅是对该蛋白研究的最初过程。
一点愚见,抛砖引玉,如有错误还要海涵。要想得到很详细的研究方案,还要楼主多查一查书和相关的文献。
For my life!
7楼2009-03-04 22:48:05
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