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木叶林森

铜虫 (小有名气)


[交流] PCR凝胶电泳图分析(小鼠组织DNA)

如图,提取小鼠DNA后PCR凝胶电泳,结果出现两条带,上面的条带是目的DNA,但下面的那些又粗又亮的条带是什么啊?还有这样的PCR产物能用于基因测序吗?

PCR凝胶电泳图分析(小鼠组织DNA)
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Rachel zou

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
下面的是引物二聚体,你可以多扩增几管,把所有产物点样到一个孔里。然后跑电泳,再做胶回收,这样,你得到的就是你的目的基因了。

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15楼2017-11-22 20:29:42
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木叶林森

铜虫 (小有名气)


这是PCR后的,不是直接用DNA跑

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3楼2017-11-22 11:17:05
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bbass533

禁虫 (小有名气)


木叶林森(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

7楼2017-11-22 11:37:40
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普通回帖

dadadalin

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
小鼠DNA这么小?降解??

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2楼2017-11-22 11:13:21
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木叶林森

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by dadadalin at 2017-11-22 11:13:21
小鼠DNA这么小?降解??

这是PCR产物电泳,不是直接拿DNA电泳

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4楼2017-11-22 11:18:08
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紫荆ysh

新虫 (小有名气)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
16楼2017-12-16 23:11:18
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ZYY张媛媛

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
这个应该是引物二聚体,你的引物用的什么浓度的啊?

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17楼2017-12-18 21:35:02
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One__Piece

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
你的引物长短应该是已知的啊,对比marker看下边带对应的bp长度应该可以知道它是不是引物二聚体吧,这是你提过DNA后PCR出来的结果,也就是不是小鼠基因组DNA了,那引物肯定也是根据目的条带设计的了吧,这样的话是不是可以考虑下边的带也是这个引物与其他位点结合扩出来的带。
18楼2017-12-19 08:54:16
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keyangbin

铜虫 (小有名气)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
这些亮及小的带为非特异性扩增的带和引物二聚体。可能模板量过大了,设计的引物也不太好,可以增加退火温度再试试。当然测序是可以的,但风险比较大,建议二次扩增后纯化再送测

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19楼2017-12-19 22:21:00
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勿忘初心球球

新虫 (小有名气)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
可能是引物二聚体,提高退火温度或降低镁离子浓度

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20楼2018-01-04 23:39:25
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shenqi955

禁虫 (初入文坛)


木叶林森(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

22楼2018-01-14 19:33:01
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进击的兔

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
底下的是引物二聚体,而且你目的条带不清晰,可能是引物设计不合理。你可以试试跑个温度梯度,然后把体系里引物的量降低。

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23楼2018-01-14 21:34:41
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赵英0709

新虫 (小有名气)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
24楼2018-03-14 18:08:05
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renweihe

新虫 (初入文坛)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
试着纯化一下,然后再去测序

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25楼2018-04-09 17:39:53
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keyangbin

铜虫 (小有名气)


建议把上面的目的条带回收纯化后再用相同的引物再次扩增后再送测,这样可以更加精确得到你所要的条带,同时测序更有保障!

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26楼2018-04-09 18:27:10
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琳琳blue

新虫 (小有名气)



木叶林森(金币+1): 谢谢参与
你提高退火温度,降低引物量,减少循环次数。重新跑一次试试

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27楼2018-11-18 22:15:54
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请回答2019

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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28楼2019-06-20 13:27:15
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简单回复
2017-11-22 11:29   回复  
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dongmings6楼
2017-11-22 11:36   回复  
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youngen8楼
2017-11-22 11:52   回复  
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gengxin609楼
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syhorchid12楼
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M塞北14楼
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2018-01-13 18:30   回复  
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