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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 16S rRNA和高通量测序
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黄双蕾_环科

金虫 (小有名气)

[求助] 16S rRNA和高通量测序 已有3人参与

我做微生物水处理的，现在培养了一个污泥，做了FISH发现有厌氧氨氧化菌，想做一个16S rRNA和高通量测序，但是我们是传统的水处理方向，没有相关设备和经验。现在想找一家公司做这两个分析，我们只负责送样品，提取、扩增、测序、分析都由公司来做，样品数量为10个左右，请各位虫友提供一些做这方面的公司的信息，谢谢谢谢！
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1楼 2017-11-14 21:16:35
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飞雪踏春

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
snoopytbw: 金币+3, 鼓励 2017-11-25 07:16:47
现在做高通量的公司很多，目前国内测序行业的老大是华大基因。诺禾致源则是专注高通量测序，目前为全国测序平台通量最大公司，而且只需要提供样本即可。个人认为这两个公司较好。

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2楼2017-11-14 22:26:46
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小楚丶

新虫 (小有名气)
预测为浮霉状菌，红色菌体，丰富在20%-30%间

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3楼2017-11-14 22:42:56
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e生物圈

捐助贵宾 (正式写手)

实验外包，请联系15110261808

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
黄双蕾_环科(小冀-代发): 金币+10, 总结很到位，鼓励一下 2017-11-15 10:20:00
snoopytbw: 金币+3, 鼓励 2017-11-25 07:17:05
华大基因都上市了，市值千亿，诺禾致源也是很厉害的公司。不过嘛，楼主的实验其实也并不是太复杂，市场上也有很多其他公司可以做，除了华大和诺禾，金唯智，贝瑞和康，博奥生物，百迈克，爱普益，泛生子，中美泰和，达安基因，安诺优达，美因基因。。。。简直不要太多了，可以说只要有测序仪都能做。不过告诉你一个事情，有的大公司的测序可能都不是自己测得，也是包给其他小公司，你的实验样品量不够的话还会碰上排队上机，凑line。所以吧，还是多跟公司沟通一下。对于你这个实验，如果实验比较重要的话，建议你找一些有经验的，专做16S的给你做菌株鉴定，高通量呢找后面分析能力强的。华大和诺禾固然很好但其他公司也是不错的。你在哪个城市啊？样品如何邮寄，实验周期，价格等等都提前问好。最后祝好！
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黄双蕾_环科
4楼2017-11-14 23:29:02
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黄双蕾_环科

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞雪踏春 at 2017-11-14 22:26:46
现在做高通量的公司很多，目前国内测序行业的老大是华大基因。诺禾致源则是专注高通量测序，目前为全国测序平台通量最大公司，而且只需要提供样本即可。个人认为这两个公司较好。
...

谢谢提供的信息
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5楼2017-11-23 13:14:46
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黄双蕾_环科

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by e生物圈 at 2017-11-14 23:29:02
华大基因都上市了，市值千亿，诺禾致源也是很厉害的公司。不过嘛，楼主的实验其实也并不是太复杂，市场上也有很多其他公司可以做，除了华大和诺禾，金唯智，贝瑞和康，博奥生物，百迈克，爱普益，泛生子，中美泰和， ...

谢谢，这些信息对现在啥也不懂的我实在是太重要了，来的太及时了，谢谢
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6楼2017-11-23 13:16:16
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nsa0804

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

厌氧氨氧化菌最好做一下绝对定量，高通量测序建议做功能基因的测序这样可以获得种的信息，如果针对16S rRNA基因测序只能到属。看你的实验目的了，祝你成功。

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努力使自己改变这世上唯一不变的就是变
7楼2017-11-25 05:52:16
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小马科研部落

新虫 (小有名气)
16S通用引物对功能基因的检出率不是太好。
建议检测厌氧氨氧化菌的功能基因，可以用二代高通量测序技术、选择厌氧氨氧化菌的特异性引物来做。
我们公司已经给中科院生态中心、南京土壤所检测过厌氧氨氧化菌哈。
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更多内容，请关注微信公众号【小马科研部落】，有问题可找QQ308091253
8楼2017-12-04 10:02:00
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attitudev

新虫 (小有名气)
请问楼主，污泥的FISH是在哪个公司做的,能否告知，谢谢
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9楼2019-04-22 14:07:20
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咋整啊

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by nsa0804 at 2017-11-25 05:52:16
厌氧氨氧化菌最好做一下绝对定量，高通量测序建议做功能基因的测序这样可以获得种的信息，如果针对16S rRNA基因测序只能到属。看你的实验目的了，祝你成功。

你好，请问这个做绝对定量有没有参考文献或者方法，最近打算做一下这个

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10楼2019-04-29 23:08:50
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