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rongyujing

新虫 (初入文坛)

[交流] psiCHECK2构建载体遇到问题

双酶切:
用的Not1和Xho1酶。载体双酶切的时候,载体长度6000+bp,双酶切,结果跑胶,有一条带(两个酶切位点之间只有30+bp,切下去了跑胶会看到吗?)。但是全部胶回收的时候有时候会有两条带,都很亮,500+bp和大于2000bp的,是质粒的不同形态吗?是不是说明我没切开?如果切开应该是什么情况?是不是要全部是线型的,然后长度就是6000+bp才对?

有几次感觉目的片段双酶切后胶回收大小也不对,本来315bp,胶回收的时候感觉在500bp左右,也不知道是怎么回事。高保真酶PCR产物和连在T载体上的都来酶切过。

连接:
我还是切了最长的那端胶回收,但是胶回收浓度都很低,10ng/ul左右,PCR产物胶回收后更低。看有的帖子说胶回收后浓度就是很低,测不出来,要看条带亮度来决定最后的体积比,但是又有人说连接比例是要看摩尔比,所以我搞不懂了。而且胶回收浓度那么低,跑胶跑的出来吗?

做了好久了,一直弄不好,还是想问每一步的结果都要怎么检测?怎样才是正确的?不然这样迷迷糊糊做到转化涂板,菌液PCR也是没结果。

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