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chemhcl

[交流] 大家看一下我设计的引物有没有问题

12个bp  5'-TTA AGT GCT CAA-3'
16个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA A-3'
20个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AA-3'
24个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AAT CAA-3'
这是我设计的DNA引物序列,各位虫友要是有检测 评价引物序列软件的能不能给我看一下有什么问题?
先谢谢了!
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muchong5577

金虫 (正式写手)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:23
这样的引物,无语啦!
短、严重的发夹结构、一般不以A作为3末端
4楼2009-02-23 17:21:27
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:21
引物那么短?12、14个bp也太短了吧~~
所有引物都会形成比较厉害的发夹结构……肉眼一看就知道了~~
2楼2009-02-23 17:10:24
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jasco

木虫 (正式写手)

GC好少,都是AT啊
3楼2009-02-23 17:20:42
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chemhcl

能不能帮我改一下啊?保持5端的序列不变,在3端增加碱基的个数就行。
我是学化学的所有对这方面不懂,我不进行PCR扩增,只要这条链和他的互补链能够进行互补配对成螺旋结构就行。
5楼2009-02-23 17:27:02
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