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abin21木虫 (著名写手)
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【求助】geom=allcheck 到底读取的哪里的构型？
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我在计算过程中首先第一个工作分两步： 第一步，做气相下的优化，用了％check=1.chk 第二步，做溶液下的优化，但是这一步优化过程非常慢，运行了一段时间，然后就停掉了。 接着做了第二个工作，在溶液中进行频率计算，用了％check=1.chk 分子说明部分用了geom=allcheck，那么这一步读取的构型是哪个？ 是气相下优化好了的构象，还是溶液中优化到半路的构型啊？ 请高手赐教！谢谢！万分感激！ [ Last edited by yuhuobuku on 2009-2-20 at 09:53 ] |
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我主要是想得到Variational C-PCM results ========================= Total free energy in solution: with all non electrostatic terms (a.u.) = -733.192171 -------------------------------------------------------------------- (Unpolarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -37.51 (Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -42.05 Solute polarization (kcal/mol) = 2.51 Total electrostatic (kcal/mol) = -39.54 -------------------------------------------------------------------- Cavitation energy (kcal/mol) = 27.87 Dispersion energy (kcal/mol) = -29.66 Repulsion energy (kcal/mol) = 4.66 Total non electrostatic (kcal/mol) = 2.88 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -36.66 -------------------------------------------------------------------- 这个结果，用的SCF=TIHGT |
3楼2009-02-20 09:07:54
erylingjet
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4楼2009-02-20 09:08:59
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yuhuobuku(金币+3,VIP+0):欢迎讨论 2-20 09:53
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楼主，在进行第二步溶剂下的结构优化的时候，chk文件名是什么设置的呢？ 要是还是采用％check=1.chk，那么你在进行第二步的时候，生成的check文件就把你第一步的check文件给覆盖了。在你后来读取check文件的时候，你读取的应该的在你第二步在液相中没有弄好的结构式的信息。 要是你在进行第二步的时候，给出了另外的check文件名，例如：％check=2.chk，那么，在进行第二步，溶剂条件下优化的时候，就自己会生成check文件，你以前气相的check文件保留着，那么你后来用％check=1.chk来读取结构式，应该是读取的第一步气相下优化好的结构信息。 |
5楼2009-02-20 09:44:51