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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】geom=allcheck 到底读取的哪里的构型？
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abin21

木虫 (著名写手)

我是就是一块木头！

[交流] 【求助】geom=allcheck 到底读取的哪里的构型？

我在计算过程中首先第一个工作分两步：
第一步，做气相下的优化，用了％check=1.chk
第二步，做溶液下的优化，但是这一步优化过程非常慢，运行了一段时间，然后就停掉了。
接着做了第二个工作，在溶液中进行频率计算，用了％check=1.chk
分子说明部分用了geom=allcheck，那么这一步读取的构型是哪个？
是气相下优化好了的构象，还是溶液中优化到半路的构型啊？

请高手赐教！谢谢！万分感激！

[ Last edited by yuhuobuku on 2009-2-20 at 09:53 ]
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1楼 2009-02-19 21:15:44
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abin21

木虫 (著名写手)

我是就是一块木头！
版主，第二步读取的哪个构象呢？ 是气相下优化好的构象还是液相下优化到半路的构象呢？
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4楼2009-02-20 09:08:59
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎讨论 2-20 09:02
abin21(金币+2,VIP+0):非常感谢，麻烦你再看看我的帖子 2-20 09:09
你这个应该是把原来的1.chk文件覆盖了.

溶液下的没有优化完,做频率就没什么意思了吧?
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2楼2009-02-20 08:42:12
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abin21

木虫 (著名写手)

我是就是一块木头！
我主要是想得到Variational C-PCM results
=========================
                     (a.u.) =    -733.133752
                     (a.u.) =    -733.193523
                     (a.u.) =    -733.196729
                     (a.u.) =    -733.129748
                     (a.u.) =    -733.196756
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =    -733.192171
--------------------------------------------------------------------
(Unpolarized solute)-Solvent             (kcal/mol) =     -37.51
(Polarized solute)-Solvent               (kcal/mol) =     -42.05
Solute polarization                      (kcal/mol) =       2.51
Total electrostatic                      (kcal/mol) =     -39.54
--------------------------------------------------------------------
Cavitation energy                        (kcal/mol) =      27.87
Dispersion energy                        (kcal/mol) =     -29.66
Repulsion energy                         (kcal/mol) =       4.66
Total non electrostatic                  (kcal/mol) =       2.88
DeltaG (solv)                            (kcal/mol) =     -36.66
--------------------------------------------------------------------
这个结果，用的SCF=TIHGT
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3楼2009-02-20 09:07:54
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
★ ★ ★
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):欢迎讨论 2-20 09:53
楼主，在进行第二步溶剂下的结构优化的时候，chk文件名是什么设置的呢？
要是还是采用％check=1.chk，那么你在进行第二步的时候，生成的check文件就把你第一步的check文件给覆盖了。在你后来读取check文件的时候，你读取的应该的在你第二步在液相中没有弄好的结构式的信息。
要是你在进行第二步的时候，给出了另外的check文件名，例如：％check=2.chk，那么，在进行第二步，溶剂条件下优化的时候，就自己会生成check文件，你以前气相的check文件保留着，那么你后来用％check=1.chk来读取结构式，应该是读取的第一步气相下优化好的结构信息。
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乐观、执着、勤奋
5楼2009-02-20 09:44:51
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