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实验室要配一个做MS的工作站，咨询一下配置问题 已有1人参与
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本人准备组一个MS用的工作站，主要用来做关于ZSM-5催化剂的分子模拟。拟定的配置如下： CPU：Intel Xeon E5-2650 V4（12核，24线程，2.2 GHz） 内存：DDR3-2133 16 GB * 4 硬盘：250 GB SSD + 2 TB SATA 芯片组：Intel C600 Series 有这些问题想咨询下大家 1： 关于CPU，E5-2650 V4（12核，24线程，2.2 GHz） 和E5-2640 V4（10核，20线程，2.4 GHz） 哪一个表现的更好一些？ 2： MS是否最多只支持8核运算？ 这里指的是8核还是8线程？ 那是否有必要配备大于8核的处理器？ 看到有人通过并联两个处理器的方法来提高计算效率，对于MS来说是否有必要？ 除此之外，也可以对这个配置其他方面提提意见。 多谢！ |
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问题1： 计算规模不仅仅与原子数有关，还与选用的计算方法、模块模切相关。 量子力学方法比分子力学方法消耗的内存大得多，在量子力学模块中，在相同的原子数下，真空层越厚，CASTEP模块比Dmol3模块更吃内存。 64G内存，用CASTEP模块，300原子+适宜厚度的真空层，应该能算。 问题2： E5-2650 V4 与 i7-6700（不管是i7-6700HQ还是i7-6700K），其实没什么可比性；前者不管是在核心数量上，还是缓存上，都碾压后者，而且有个重要的问题，分子模拟属于大规模计算，尤其看重计算的长久稳定性，前者正是为此而设计的，而后者仅适用于家用，不适合分子模拟计算。你用 i7-6700算觉得很慢，现在用E5-2650 V4线程全开来算，也不见得能快多少，但E5-2650 V4能长期稳定运行，直到计算结束， i7-6700 不一定，不确定性大。 要量化比较，你可以搜一下两者的跑分。 |
7楼2017-10-24 13:53:30
谁家那小孩
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3楼2017-10-20 09:00:58
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【答案】应助回帖
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两个处理器的官方比较数据见如下链接： https://www.intel.cn/content/www ... ductIds=92984,91767  1.jpg 对于问题1 论CPU性能，自然是E5-2650 V4更好。 对于问题2 MS是否最多只支持8核运算？ 答：应该不是，印象中32核都可以。 这里指的是8核还是8线程？ 答：应该是线程。我曾用过4核心8线程的CPU，MS中显示为8 cores。 那是否有必要配备大于8核的处理器？ 答：有必要。比如同时进行2个任务，可每个任务分配10个核。 看到有人通过并联两个处理器的方法来提高计算效率，对于MS来说是否有必要？ 答：并联两个处理器自然更快。至少说有没有必要，加CPU主要是加快计算速度，所以加不加CPU主要看你要计算的系统的大小，以及对计算时间的要求。 老生常谈的一句话是，内存决定能构建模型的大小，CPU决定计算速度。 你目前的配置 12核，24线程 + 64 G内存，对于一般建模和计算，应该都没问题了。 最后，我问你一下，你配的是DELL的？ |
4楼2017-10-20 11:56:44
