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【求助】关于分子构象库的过滤
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向大家问个问题：我有一个数据库，这个数据库中是某一个分子的不同构象，因为这个分子的柔性很大，所以我搜索了大概几百个构象，我现在想通过比较RMS值的方法把这个库中的重复构象的分子删除掉，请问用什么软件可以做到？ [ Last edited by zdhlover on 2009-11-30 at 15:21 ] |
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mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢！ 2-22 15:16
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢！ 2-22 15:16
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可以用分子叠合的方式进行，这个可以用 ccl 上的一个小软件进行： http://www.ccl.net/cca/software/SOURCES/C/quaternion-mol-fit/ 但让哪两个结构式进行比较，这需要你自己来指定的。 |
6楼2009-02-22 11:31:40
