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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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damaoouba

木虫 (正式写手)

[求助] 转录组测序过程中为什么要将富集的RNA随机打断成片段? 已有1人参与

这个地方我有点想不明白。为什么要将oligoDT富集的mRNA随机打断成片段之后再反转成cDNA呢?有什么好处?如果不片段化会出现什么后果呢?
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chenj-315

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 原来,是这样 at 2017-10-09 12:36:40
细胞里面一个基因mRNA不可能只有一条,多条都是随机打断是很容易通过软件对比拼接的
...

谢谢!还有一些疑问,像一些单细胞测序的方法有一些mRNA含量可能也只有几个拷贝,这种情况下通过软件比对是否准确率很低呢?

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7楼2017-10-09 12:48:04
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原来,是这样

金虫 (小有名气)

一般测序都是几百几百的测,一次测的太长后面就不准了,所以打成随机片段测序完了再拼接,保证准确性。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-10-09 11:48:25
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damaoouba

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原来,是这样 at 2017-10-09 11:48:25
一般测序都是几百几百的测,一次测的太长后面就不准了,所以打成随机片段测序完了再拼接,保证准确性。

谢谢~!明白啦!
3楼2017-10-09 12:24:18
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chenj-315

银虫 (正式写手)

一条mRNA被打断之后进行测序怎么知道整条mRNA的序列信息呢?

发自小木虫Android客户端
4楼2017-10-09 12:26:08
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