应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 转录组测序过程中为什么要将富集的RNA随机打断成片段？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
101/1返回列表
查看: 4999  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

damaoouba

木虫 (正式写手)

[求助] 转录组测序过程中为什么要将富集的RNA随机打断成片段？ 已有1人参与

这个地方我有点想不明白。为什么要将oligoDT富集的mRNA随机打断成片段之后再反转成cDNA呢？有什么好处？如果不片段化会出现什么后果呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-10-09 11:23:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原来，是这样

金虫 (小有名气)
一般测序都是几百几百的测，一次测的太长后面就不准了，所以打成随机片段测序完了再拼接，保证准确性。

发自小木虫Android客户端
赞一下(3人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

damaoouba
2楼2017-10-09 11:48:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaoouba

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原来，是这样 at 2017-10-09 11:48:25
一般测序都是几百几百的测，一次测的太长后面就不准了，所以打成随机片段测序完了再拼接，保证准确性。

谢谢~！明白啦！
回复此楼
3楼2017-10-09 12:24:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenj-315

银虫 (正式写手)
一条mRNA被打断之后进行测序怎么知道整条mRNA的序列信息呢？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2017-10-09 12:26:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaoouba

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原来，是这样 at 2017-10-09 11:48:25
一般测序都是几百几百的测，一次测的太长后面就不准了，所以打成随机片段测序完了再拼接，保证准确性。

一条mRNA被打断之后进行测序怎么知道整条mRNA的序列信息呢？
赞一下 回复此楼
5楼2017-10-09 12:34:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原来，是这样

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
damaoouba: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2017-10-09 12:37:24
引用回帖:
4楼: Originally posted by chenj-315 at 2017-10-09 12:26:08
一条mRNA被打断之后进行测序怎么知道整条mRNA的序列信息呢？

细胞里面一个基因mRNA不可能只有一条，多条都是随机打断是很容易通过软件对比拼接的

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2017-10-09 12:36:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenj-315

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 原来，是这样 at 2017-10-09 12:36:40
细胞里面一个基因mRNA不可能只有一条，多条都是随机打断是很容易通过软件对比拼接的
...

谢谢！还有一些疑问，像一些单细胞测序的方法有一些mRNA含量可能也只有几个拷贝，这种情况下通过软件比对是否准确率很低呢？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2017-10-09 12:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原来，是这样

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chenj-315 at 2017-10-09 12:48:04
谢谢！还有一些疑问，像一些单细胞测序的方法有一些mRNA含量可能也只有几个拷贝，这种情况下通过软件比对是否准确率很低呢？
...

其实两个都是可以拼接的，但是在高通量里面两个拷贝的确容易出现不靠谱情况，但是几个拷贝的话还是没有什么问题的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2017-10-09 13:15:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damaoouba

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 原来，是这样 at 2017-10-09 13:15:53
其实两个都是可以拼接的，但是在高通量里面两个拷贝的确容易出现不靠谱情况，但是几个拷贝的话还是没有什么问题的。
...

还有一点不太明白。请问桥式扩增之前添加的接头是什么作用呢？5‘和3’端的接头有什么差别？
赞一下 回复此楼
9楼2017-10-09 13:18:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原来，是这样

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by damaoouba at 2017-10-09 13:18:47
还有一点不太明白。请问桥式扩增之前添加的接头是什么作用呢？5‘和3’端的接头有什么差别？...

这个东西不好说清楚，看一次视频就能知道为什么了，网上可以搜到的，我们老师给我们放过。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2017-10-09 15:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 damaoouba 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 甲基亚磺磺酸钠和甲基磺酸酯反应机理 10+3 kaobao456 2026-03-29 4/200 2026-03-30 23:16 by nBu锂
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
[考研] 359求调剂 +5 王了个楠 2026-03-25 5/250 2026-03-30 19:36 by 源_2020
[考研] 311求调剂 +7 蓝月亮亮 2026-03-30 7/350 2026-03-30 19:24 by 无际的草原
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +18 Mr. Z 2026-03-25 19/950 2026-03-30 19:01 by Wang200018
[考研] 324求调剂 +9 hanamiko 2026-03-26 11/550 2026-03-30 14:27 by JourneyLucky
[考研] 348求调剂 +6 小懒虫不懒了 2026-03-28 6/300 2026-03-30 10:29 by Evan_Liu
[考研] 356求调剂 +4 gysy?s?a 2026-03-28 4/200 2026-03-29 10:32 by 唐沐儿
[考研] 数一英一271专硕（085401）求调剂，可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 0703化学调剂，求导师收 +9 天天好运来上岸� 2026-03-24 10/500 2026-03-28 22:17 by chemzp
[考研] 一志愿太原理工安全工程300分，求调剂 +5 0857求调剂. 2026-03-24 6/300 2026-03-28 22:04 by zhq0425
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +12 路痴小琪 2026-03-27 12/600 2026-03-28 15:41 by L135790
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 08开头275求调剂 +4 拉谁不重要 2026-03-26 4/200 2026-03-27 14:12 by Delta2012
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭