应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps 中create_atoms添加分子
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 2235  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

liuliyanatqx

金虫 (著名写手)

[求助] lammps 中create_atoms添加分子 已有1人参与

求教各位大神，有没有用lammps做层层自组装的？怎样用creat_atoms命令来添加分子？谢谢了！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2017-09-20 15:49:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逆风milk

新虫 (初入文坛)
请问楼主解决了吗，可以讨论讨论吗？
赞一下 回复此楼
5楼2019-11-04 11:14:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

琳达的情人

金虫 (小有名气)
先用molecule读入分子

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

liuliyanatqx
2楼2017-09-21 07:07:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuliyanatqx

金虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 琳达的情人 at 2017-09-21 07:07:34
先用molecule读入分子

您能给我发一个molecule 的模板吗？我按照lammps mamual手册编了一个，在运行过程中既不提示错误，也不运行。非常感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2017-09-22 08:38:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

iSimuLy

捐助贵宾 (正式写手)

资深专家顾问

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liuliyanatqx: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 非常感谢您的帮助！祝心想事成！ 2017-09-29 08:42:27
########## SPC/E model

3 atoms
2 bonds
1 angles

Coords

1   0.816490   0.577359    0.000000
2   0.000000   0.000000    0.000000
3   1.632980   0.000000    0.000000

Types

1  1
2  2
3  2

Charges

1   -0.8476  
2   0.4238  
3   0.4238

Bonds

1  1  1 2
2  1  1 3

Angles

1  1  2 1 3

Special Bond Counts

1   2 0 0
2   1 1 0  
3   1 1 0

Special Bonds

1   2 3
2   1 3  
3   1 2

Shake Flags

1   1
2   2
3   2

Shake Atoms

1   1 2 3
2   1 2
3   1 3

Shake Bond Types

1   1 1 1
2   1
3   1
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

知行合一XZ
4楼2017-09-27 09:32:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 食品与营养（0955）271求调剂 +12 升格阿达 2026-04-12 12/600 2026-04-14 09:36 by 带壳的鸡蛋
[考研] 本科211，报考085601-310分 +13 ararak 2026-04-13 13/650 2026-04-14 09:28 by 852137818
[教师之家] 转长聘了 +4 简单化xn 2026-04-13 4/200 2026-04-14 08:27 by syl200707
[考研] 化学070300 求调剂 +21 哈哈哈^_^ 2026-04-12 21/1050 2026-04-13 21:36 by nxybio2007
[考研] 297工科，求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] 求调剂，一志愿材料科学与工程985，365分， +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 331求调剂 +5 王国帅 2026-04-11 5/250 2026-04-11 22:56 by 溪涧流水
[考研] 269求调剂 +11 啊啊我我 2026-04-07 11/550 2026-04-11 16:45 by vgtyfty
[考研] 调剂求助 +6 果然有我 2026-04-11 7/350 2026-04-11 16:22 by 明月此时有
[考研] 调剂 +4 电气300求调剂不 2026-04-08 7/350 2026-04-11 10:44 by 紫曦紫棋
[考研] 机械专硕270求调剂，接受跨专业 +12 老师看看我吧aba 2026-04-09 14/700 2026-04-11 10:21 by laoshidan
[考研] 282，求调剂 +12 jggshjkkm 2026-04-09 14/700 2026-04-11 09:39 by 猪会飞
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 一志愿211，化学310分，本科重点双非，求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 中科院总分315求调剂 +8 lallalh 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:30 by dick_runner
[考研] 一志愿中科院105500专业总分315求调剂 +6 lallalh 2026-04-09 7/350 2026-04-09 17:51 by lallalh
[考研] 化学工程与技术专业一志愿哈工程 291分B区 国家级大创负责人 有一作论文 +13 Emmy~ 2026-04-09 13/650 2026-04-09 14:47 by only周
[考研] 材料307分求大佬组收留 +17 Hll胡 2026-04-07 17/850 2026-04-09 10:53 by liuhuiying09
[考研] 263分B区求调剂 +6 李nihao 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:38 by 南开小綦
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭