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杜一无二

银虫 (小有名气)


[资源] 石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒

核酸提取试剂
说明书
【产品名称】
石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒
【包装规格】
型号:FFPE  DNA/RNA   货号:KR008C/50次
【预期用途】
用于核酸的提取、富集、纯化等步骤。其处理后的产物用于临床体外检测使用。
【提取原理】
本试剂盒为从经福尔马林固定石蜡包埋组织(简称FFPE)中提取DNA提供一种高质量、快速、高效的方法。本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统。离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司特有新型材料,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。
使用本试剂盒提取DNA无需用二甲苯去蜡,操作简单、安全。提取所得的DNA可直接应用于PCR等下游实验。
【主要组成成分】
产品组成        规格        说明        保存条件
除蜡液DB        17 mL                室温
裂解液LB        22 mL               
洗涤液WB1        6 mL        WB1使用前需按1:4用无水乙醇稀释       
洗涤液WB2        28 mL        WB2使用前需加入
84 mL无水乙醇       
无核酸酶污染 纯水        6 mL               
洗涤液WB1稀释瓶
7-mL         1只               
50% 甘油        1 mL               
DNA 吸附柱        50支               
收集管2-mL        50支               
无核酸酶污染离心管
1.5-mL        50支               
Proteinase K         1瓶        使用前加入550 μL 50% 甘油,于-20℃保存        4℃
                       
*已充分考虑到每次吸取试剂时的损耗,试剂有效期为12个月。
【注意事项】
1.        试剂盒中Proteinase K为冻干粉,于4℃保存;使用前加入550 μL 50%甘油后于-20℃保存。
2.        洗涤液WB1在使用前需按1:4用无水乙醇稀释,稀释液可在室温下保存1周。洗涤液WB1稀释瓶供步骤10中稀释WB1使用。
3.        第一次使用前应在洗涤液WB2中加入84 mL无水乙醇。
4.        需自备若干无菌1.5-mL离心管,本试剂盒提供的50支无核酸酶污染的离心管仅用于收集最终提取的DNA溶液。
5.        除温浴步骤外,其余步骤在室温下(15-25℃)操作。
【操作步骤】
1.        将石蜡样品切成5-10 μm厚的切片。
注意:若石蜡块保存于室温,则弃去起始的2~3片切片。切片厚度以
5 μm为佳,适当去除无组织的蜡质可提高提取效率。
2.        将4-8片切片置于1.5-mL离心管中(自备),加入300 μL除蜡液DB。
3.         将离心管置于80 ℃孵育30 min,期间10 min后取出短暂涡旋混匀。
注意:此步骤使组织块与除蜡液充分混匀。当样品量较大时,蜡质溶化后组织块可能粘在离心管壁上,影响提取效率。
4.        于室温冷却2-3 min,加入10 μL的蛋白酶K,涡旋混匀,55 ℃孵育30-60 min至无明显组织块。(视组织量的多少,可酌情减少或增加孵育时间。)
5.        13,000 rpm离心1 min。用枪头小心刺穿液面表层蜡膜,取下层清液至新的1.5-mL离心管中(自备)。
注意:切勿吸到上层浑浊蜡层,否则石蜡可能对DNA纯度有影响。
6.        加入400 μL裂解液LB,颠倒混匀,室温静置10 min。
7.        加入800 μL无水乙醇,涡旋10 sec。
8.        将吸附柱置于2-mL收集管中,再将上述液体转移至吸附柱中,每次加入750 μL,13,000 rpm离心1 min,弃收集管中的滤液。
9.        重复步骤8,直至将所有溶液都经过吸附柱过滤,弃滤液。
10.        向吸附柱中加入已用无水乙醇配制的洗涤液WB1 500 μL,13,000 rpm离心1 min,弃废液。
注意:洗涤液WB1在使用前需按1:4用无水乙醇稀释(例如:若提取10个样本的DNA,则取1 mL洗涤液WB1加入4 mL无水乙醇)。稀释液可在室温下保存1周。
11.        将吸附柱重新放回2-mL收集管中,加入600 μL洗涤液WB2,13,000 rpm离心1 min,弃废液。
注意:初次使用前需向洗涤液WB2中加84 mL的无水乙醇,并振荡混匀。
12.        重复步骤11两次。
13.        将吸附柱重新放回2-mL收集管中,于室温13,000 rpm空柱离心1 min后,置于新的1.5-mL无核酸酶污染的离心管中。开盖室温静置或超净工作台风干5 min,以彻底挥发残余的乙醇。
注意:残留的乙醇可能会影响后续的PCR等实验。
14.        向吸附柱柱膜中央上方小心加入35-100 μL无核酸酶污染的纯水(此步骤请谨慎操作,枪头请勿接触柱膜,纯水经65 ℃温浴后再加入有助于提高洗脱效率),室温静置3-5 min,13,000 rpm离心1 min,洗脱液即为DNA溶液。(建议:为提高DNA浓度,可将洗脱液重新加回柱膜中央,静置3 min后,以13,000 rpm离心1 min洗脱DNA。)
注意:洗脱缓冲液体积不应少于35 μL,体积过小影响回收效率。需长期保存DNA时建议用TE缓冲液(10mM Tris-HCl,1mM EDTA pH8.0)洗脱。

【应用实例】

图一:使用本试剂盒提取弥漫性大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织(5 μm, 6 片)DNA,再以人GAPDH为目的基因进行qPCR;同时,用纯水作为阴性对照。结果显示,DNA的PCR基因扩增良好,而纯水无PCR扩增;表明本试剂盒所提取的DNA质量好,可直接运用于下游PCR等后续实验。
曲线1:样本为弥漫性大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织DNA
曲线2:样本为纯水石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒
22.png
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  • 2017-09-15 09:07:02, 186.66 K

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宇宙小妖怪

铁虫 (小有名气)


★ 一星级,一般

实验室用的BIOG DNA FFPE Tissue Kit,里面的裂解液、消化液无需过夜温育就可以从福尔马林固定的、石蜡包埋组织中高效纯化基因组DNA
2楼2019-03-12 08:47:39
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