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[资源]
石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒
核酸提取试剂
说明书
【产品名称】
石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒
【包装规格】
型号:FFPE DNA/RNA 货号:KR008C/50次
【预期用途】
用于核酸的提取、富集、纯化等步骤。其处理后的产物用于临床体外检测使用。
【提取原理】
本试剂盒为从经福尔马林固定石蜡包埋组织(简称FFPE)中提取DNA提供一种高质量、快速、高效的方法。本试剂盒采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统。离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司特有新型材料,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。
使用本试剂盒提取DNA无需用二甲苯去蜡,操作简单、安全。提取所得的DNA可直接应用于PCR等下游实验。
【主要组成成分】
产品组成 规格 说明 保存条件
除蜡液DB 17 mL 室温
裂解液LB 22 mL
洗涤液WB1 6 mL WB1使用前需按1:4用无水乙醇稀释
洗涤液WB2 28 mL WB2使用前需加入
84 mL无水乙醇
无核酸酶污染 纯水 6 mL
洗涤液WB1稀释瓶
7-mL 1只
50% 甘油 1 mL
DNA 吸附柱 50支
收集管2-mL 50支
无核酸酶污染离心管
1.5-mL 50支
Proteinase K 1瓶 使用前加入550 μL 50% 甘油,于-20℃保存 4℃
*已充分考虑到每次吸取试剂时的损耗,试剂有效期为12个月。
【注意事项】
1. 试剂盒中Proteinase K为冻干粉,于4℃保存;使用前加入550 μL 50%甘油后于-20℃保存。
2. 洗涤液WB1在使用前需按1:4用无水乙醇稀释,稀释液可在室温下保存1周。洗涤液WB1稀释瓶供步骤10中稀释WB1使用。
3. 第一次使用前应在洗涤液WB2中加入84 mL无水乙醇。
4. 需自备若干无菌1.5-mL离心管,本试剂盒提供的50支无核酸酶污染的离心管仅用于收集最终提取的DNA溶液。
5. 除温浴步骤外,其余步骤在室温下(15-25℃)操作。
【操作步骤】
1. 将石蜡样品切成5-10 μm厚的切片。
注意:若石蜡块保存于室温,则弃去起始的2~3片切片。切片厚度以
5 μm为佳,适当去除无组织的蜡质可提高提取效率。
2. 将4-8片切片置于1.5-mL离心管中(自备),加入300 μL除蜡液DB。
3. 将离心管置于80 ℃孵育30 min,期间10 min后取出短暂涡旋混匀。
注意:此步骤使组织块与除蜡液充分混匀。当样品量较大时,蜡质溶化后组织块可能粘在离心管壁上,影响提取效率。
4. 于室温冷却2-3 min,加入10 μL的蛋白酶K,涡旋混匀,55 ℃孵育30-60 min至无明显组织块。(视组织量的多少,可酌情减少或增加孵育时间。)
5. 13,000 rpm离心1 min。用枪头小心刺穿液面表层蜡膜,取下层清液至新的1.5-mL离心管中(自备)。
注意:切勿吸到上层浑浊蜡层,否则石蜡可能对DNA纯度有影响。
6. 加入400 μL裂解液LB,颠倒混匀,室温静置10 min。
7. 加入800 μL无水乙醇,涡旋10 sec。
8. 将吸附柱置于2-mL收集管中,再将上述液体转移至吸附柱中,每次加入750 μL,13,000 rpm离心1 min,弃收集管中的滤液。
9. 重复步骤8,直至将所有溶液都经过吸附柱过滤,弃滤液。
10. 向吸附柱中加入已用无水乙醇配制的洗涤液WB1 500 μL,13,000 rpm离心1 min,弃废液。
注意:洗涤液WB1在使用前需按1:4用无水乙醇稀释(例如:若提取10个样本的DNA,则取1 mL洗涤液WB1加入4 mL无水乙醇)。稀释液可在室温下保存1周。
11. 将吸附柱重新放回2-mL收集管中,加入600 μL洗涤液WB2,13,000 rpm离心1 min,弃废液。
注意:初次使用前需向洗涤液WB2中加84 mL的无水乙醇,并振荡混匀。
12. 重复步骤11两次。
13. 将吸附柱重新放回2-mL收集管中,于室温13,000 rpm空柱离心1 min后,置于新的1.5-mL无核酸酶污染的离心管中。开盖室温静置或超净工作台风干5 min,以彻底挥发残余的乙醇。
注意:残留的乙醇可能会影响后续的PCR等实验。
14. 向吸附柱柱膜中央上方小心加入35-100 μL无核酸酶污染的纯水(此步骤请谨慎操作,枪头请勿接触柱膜,纯水经65 ℃温浴后再加入有助于提高洗脱效率),室温静置3-5 min,13,000 rpm离心1 min,洗脱液即为DNA溶液。(建议:为提高DNA浓度,可将洗脱液重新加回柱膜中央,静置3 min后,以13,000 rpm离心1 min洗脱DNA。)
注意:洗脱缓冲液体积不应少于35 μL,体积过小影响回收效率。需长期保存DNA时建议用TE缓冲液(10mM Tris-HCl,1mM EDTA pH8.0)洗脱。
【应用实例】
图一:使用本试剂盒提取弥漫性大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织(5 μm, 6 片)DNA,再以人GAPDH为目的基因进行qPCR;同时,用纯水作为阴性对照。结果显示,DNA的PCR基因扩增良好,而纯水无PCR扩增;表明本试剂盒所提取的DNA质量好,可直接运用于下游PCR等后续实验。
曲线1:样本为弥漫性大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织DNA
曲线2:样本为纯水![石蜡包埋组织(FFPE)DNA提取试剂盒]()
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- 附件 1 : KR008C-石蜡包埋组织DNA提取试剂盒.pdf
2017-09-15 09:07:02, 186.66 K
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