24小时热门版块排行榜    

查看: 2064  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

alv368

新虫 (初入文坛)

[求助] MS Amorphous cell中构建晶胞缺少力场参数 已有2人参与

我在MS Amorphous cell中构建晶胞,体系中含有氯化氢分子,乙炔和季鏻盐,用CVFF力场计算显示没有氯化氢分子的力场参数(Can't assign forcefield atom types to the constituent molecules. The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 2 atoms.
The charging engine has failed to calculate a charge for 2 atoms.),但是用Cl原子和H原子分别模拟都可以计算。然后我尝试了系统里自带的所有的力场,都提示有些原子没有力场参数(compass,cff,pcff)。那我想问一下这样就是不能建立无定形晶胞了?本来是打算跑动力学的,想问一下还有没有解决的方法?谢谢啦
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首先需要确定 氯化氢 分子存在吗? 力场也是人开发的,开发力场也是基于物理和化学原理的,不会去开发不常见的分子的力场,更不会去开发不存在的分子的力场

一般情况下  HCl  是以H+  和 Cl-  的形式存在的,所以H+  和 Cl-   的力场都是很常见的,而HCl的力场不常见。
5楼2017-09-22 09:45:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

sunny11223

铁杆木虫 (著名写手)

检查一下你构建的基本单元 氯化氢分子,乙炔和季鏻盐,是否正确

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-08-25 22:17:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alv368

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sunny11223 at 2017-08-25 22:17:01
检查一下你构建的基本单元 氯化氢分子,乙炔和季鏻盐,是否正确

不好意思回复晚了,我有重新画过分子,应该结构没有错
我在Amorphous cell calculation中选择了construction,然后选择了COMPASS 和COMPASSⅡ力场分别计算,就可以计算了。但是直接选择Amorphous cell 模块的construction,就不可以计算,我想知道这俩个有什么区别?
3楼2017-08-31 14:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月上狼图

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

哇 我遇到同样的问题,楼主知道这是怎么回事了吗
4楼2017-09-21 23:51:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 XlxB7q11Bc3x 2026-09-01 3/150 2026-09-01 21:52 by Y3OMSsg8u9zj
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见