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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS Amorphous cell中构建晶胞缺少力场参数
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alv368

新虫 (初入文坛)

[求助] MS Amorphous cell中构建晶胞缺少力场参数 已有2人参与

我在MS Amorphous cell中构建晶胞，体系中含有氯化氢分子，乙炔和季鏻盐，用CVFF力场计算显示没有氯化氢分子的力场参数（Can't assign forcefield atom types to the constituent molecules. The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 2 atoms.
The charging engine has failed to calculate a charge for 2 atoms.），但是用Cl原子和H原子分别模拟都可以计算。然后我尝试了系统里自带的所有的力场，都提示有些原子没有力场参数（compass,cff,pcff）。那我想问一下这样就是不能建立无定形晶胞了？本来是打算跑动力学的，想问一下还有没有解决的方法？谢谢啦
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1楼 2017-08-25 09:58:38
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sunny11223

铁杆木虫 (著名写手)
检查一下你构建的基本单元 氯化氢分子，乙炔和季鏻盐，是否正确

发自小木虫IOS客户端
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2楼2017-08-25 22:17:01
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alv368

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sunny11223 at 2017-08-25 22:17:01
检查一下你构建的基本单元 氯化氢分子，乙炔和季鏻盐，是否正确

不好意思回复晚了,我有重新画过分子，应该结构没有错
我在Amorphous cell calculation中选择了construction,然后选择了COMPASS 和COMPASSⅡ力场分别计算，就可以计算了。但是直接选择Amorphous cell 模块的construction，就不可以计算，我想知道这俩个有什么区别？
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3楼2017-08-31 14:35:42
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月上狼图

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

哇 我遇到同样的问题，楼主知道这是怎么回事了吗
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4楼2017-09-21 23:51:16
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首先需要确定 氯化氢 分子存在吗？ 力场也是人开发的，开发力场也是基于物理和化学原理的，不会去开发不常见的分子的力场，更不会去开发不存在的分子的力场

一般情况下  HCl  是以H+  和 Cl-  的形式存在的，所以H+  和 Cl-   的力场都是很常见的，而HCl的力场不常见。
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5楼2017-09-22 09:45:14
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