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关于菌批验证结果和测序结果不一致的原因
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通过酶切和酶连构建一个载体，我做菌批验证的时候，用的是我自己片段的引物验证，能够p出来正确的条带，然后我送去测序，测序结果是空载体。 请问这是为什么？ 发自小木虫Android客户端 |
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5楼2017-08-20 14:27:03
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你说的是菌批验证是菌落pcr？如果是的话，不知道你做的时候有没有做隐性对照，如果没做的话可能是污染了，如果做了阴性没有带，其他的有目的条带的话我建议以测序结果为准 发自小木虫IOS客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2017-08-19 23:20:48
送红花一朵 |
您好，请问阴性对照怎么个做法。我是用我自己片段的引物批的，师兄说他都用载体上的通用引物批，然后我用通用引物批了一下，的确还是空载。所以我现在就是好奇哪里出了问题，怎么用我自己引物会批出条带，一般是怎么个污染法呢？ 谢谢。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-08-20 12:55:08
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其实用载体上的引物和你自己的引物没有区别，如果照你这么说很大的可能是你本身引起的问题，一是你的引物特异性不高，你pcr里的条带是杂带只不过大小刚好跟你要的目的条带一样，而是你的引物在稀释或者使用过程中污染了。建议你在做的时候其中一个平行管里不加模版也就是不加菌，其他都一样作为阴性（目的看你的引物有没有污染），另外可以加一个以空载质粒为模版的管（质粒稀释成1ng/ul，pcr体系中加1ul，目的是看你的引物是不是特异性不高）希望我说的你能明白 发自小木虫IOS客户端 |
4楼2017-08-20 14:25:39
