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莘芷

新虫 (初入文坛)

[求助] 核酸 已有2人参与

怎样进行核酸多条序列与一天序列比对

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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用软件就可以进行比对,可以选择免费的mega系列的软件,多序列比对没有问题的。
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
2楼2017-07-25 15:48:41
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
步骤:
1,打开NCBI主页www.ncbi.nlm.nih.gov,左边search里面选择GENE 右边的对话框for里输入你想要的基因名称(NM_001101。
2,在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,Homo sapiens是人,选择第一个。
3,再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择FASTA。
4,显示的是他的基因序列,点击Download选择FASTA下载。
5,打开NCBI的Blast界面,选择Basic   Blast里的nucleotide blast。
6,添加已下载核酸序列,Database里选择Human,再点击最下面的Blast。
7,Blast对比结果。
8,在比对结果中选择前十个序列,下载到本地电脑中 。
9,下载的十个序列结合原有的待测序列,加载到ClustalX软件进行多重序列比对  。输出格式选择CLASTAL和PIR。进行完全对比。
10,对比结果。生成的dnd文件。生成的aln文件。
及时行乐,人生不留遗憾!
3楼2017-07-25 16:59:39
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