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yeahhanpei金虫 (正式写手)
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[交流]
请问怎么找到各个分子的偶极矢量
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如图中文字所述，要找到AC 分子的偶极矢量夹角与质心坐标的关系，有两个问题: 1.在MS中怎么样才能找到分子的偶极矢量方向？ 2.如何可以找到质心，因为分子比较多，一个一个的找很繁琐，想问下有木有简单的方法可以全部找出来？  发自小木虫Android客户端 |
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yeahhanpei: 金币+5 2017-07-24 11:32:54
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yeahhanpei: 金币+5 2017-07-24 11:32:54
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具体是什么分子呢？还有，你的很多分子有多少？是用动力学处理的吗 发自小木虫Android客户端 |
4楼2017-07-24 09:43:22
dingweilu
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yeahhanpei: 金币+3 2017-07-23 09:23:41
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yeahhanpei: 金币+3 2017-07-23 09:23:41
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就是计算分子偶极距投影到垂直于分子吸附表面轴上的分量 发自小木虫Android客户端 |
2楼2017-07-22 23:45:46
yeahhanpei
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5楼2017-07-24 11:00:08
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yeahhanpei6楼2017-07-25 16:05:02
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7楼2017-07-26 09:09:34
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8楼2017-07-26 09:41:16
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具体来说就是我帮你优化了丙酮，发现它的羰基碳原子就是质心，那我觉得可以这样，偶极距的其中一个分量正好是处在羰基键伸缩方向的，所以对于轨迹生成的系列构象的坐标写脚本或者导入excel用公式编辑，但是默认质心不变，这样只需要对有变化的构象求cos角就够了 发自小木虫Android客户端 |
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9楼2017-07-26 09:46:35
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10楼2017-07-26 09:47:02