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yeahhanpei

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[交流] 请问怎么找到各个分子的偶极矢量

如图中文字所述，要找到AC 分子的偶极矢量夹角与质心坐标的关系，有两个问题:
1.在MS中怎么样才能找到分子的偶极矢量方向？
2.如何可以找到质心，因为分子比较多，一个一个的找很繁琐，想问下有木有简单的方法可以全部找出来？

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我的梦想那么大，我却离得那么远！

1楼 2017-07-22 20:45:24

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yeahhanpei

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引用回帖:

9楼: Originally posted by dingweilu at 2017-07-26 09:46:35
具体来说就是我帮你优化了丙酮，发现它的羰基碳原子就是质心，那我觉得可以这样，偶极距的其中一个分量正好是处在羰基键伸缩方向的，所以对于轨迹生成的系列构象的坐标写脚本或者导入excel用公式编辑，但是默认质心 ...

美女姐姐，我可不可以这样理解：找到轨迹中丙酮分子的质心，然后各个分子的偶极矩方向是和相应分子的质心（坐标）有关的，这样也就知道了偶极矩的方向，再然后就可以得到各个偶极矩与Z轴的夹角了θ 了。（前提是需要把轨迹文件坐标转换出来）。这样应该是对的吧