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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 内生真菌的鉴定
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ytirhjv

新虫 (正式写手)
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内生真菌的鉴定
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本人是药学专业，已从药用植物组织中分离纯化出24株内生真菌，但是对于菌种鉴定这方面了解甚少，请问大家一般对于内生真菌是怎么鉴定的？如果需要专门的真菌鉴定所，大家可否有推荐？已在电子显微镜下观察过。

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1楼 2017-07-19 21:35:09
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11石宝

新虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我只知道一般细菌和真菌的鉴定方法，不知道对你有没有帮助。首先是分离纯化，确定为单一菌株，然后送去外面公司测16s rDNA系列（上海生工or大连宝生物，我就是送这两个的，好像后者更加精确一点，但是价格贵），得到的序列自己去NCBI上比对，就可以鉴定到属了（只测序，不用他们分析，测序便宜，让他们分析价格贵），确定可能的种。然后根据生理生化实验，API指标、BIOLOG板鉴定确定种，更高级的鉴定新种的办法是DNA杂交or全基因组序列+ANI分析技术（一般不用）。
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91楼2017-07-20 09:58:26
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来至1900

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1、提DNA,测ITS序列，在NCBI上比对，上海生工可测序列
2、查阅中国真菌志和其他文献资料，进行形态学鉴定，以形态学鉴定为准。
祝成功
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98楼2017-08-02 15:06:29
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桃核儿

捐助贵宾 (职业作家)
24株？好多呀！

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6楼2017-07-19 21:37:36
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质谱初学者

新虫 (初入文坛)
基因测序

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15楼2017-07-19 21:50:54
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qhuaxmchong

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
建议这种事情最好合作，专业的事找专业的人。或者直接找公司帮你做，前提是你懂的鉴别公司给的结果。实验室有钱，就找中科院微生物所鉴定。你说应电子显微镜看过了，没有初步鉴定之前，应电子显微镜看，有点大炮打蚊子的感觉

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85楼2017-07-20 08:15:00
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ytirhjv

新虫 (正式写手)
引用回帖:
85楼: Originally posted by qhuaxmchong at 2017-07-20 08:15:00
建议这种事情最好合作，专业的事找专业的人。或者直接找公司帮你做，前提是你懂的鉴别公司给的结果。实验室有钱，就找中科院微生物所鉴定。你说应电子显微镜看过了，没有初步鉴定之前，应电子显微镜看，有点大炮打蚊 ...

，大炮打蚊子。宝宝好像打完后还是拎不清。

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92楼2017-07-20 12:34:51
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ytirhjv

新虫 (正式写手)
引用回帖:
91楼: Originally posted by 11石宝 at 2017-07-20 09:58:26
我只知道一般细菌和真菌的鉴定方法，不知道对你有没有帮助。首先是分离纯化，确定为单一菌株，然后送去外面公司测16s rDNA系列（上海生工or大连宝生物，我就是送这两个的，好像后者更加精确一点，但是价格贵），得到 ...

好的，谢谢。

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93楼2017-07-20 12:35:52
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路灯ing

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
91楼: Originally posted by 11石宝 at 2017-07-20 09:58:26
我只知道一般细菌和真菌的鉴定方法，不知道对你有没有帮助。首先是分离纯化，确定为单一菌株，然后送去外面公司测16s rDNA系列（上海生工or大连宝生物，我就是送这两个的，好像后者更加精确一点，但是价格贵），得到 ...

大哥。请问如何比对呢

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95楼2017-07-20 13:06:04
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11石宝

新虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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95楼: Originally posted by 路灯ing at 2017-07-20 13:06:04
大哥。请问如何比对呢
...

NCBI官网，找到BLAST，选择你的16S rDNA片段的来源（微生物，动物。。。），出现如图所示页面，复制黏贴序列，其他条件看你情况选择。网上应该也有相关NCIB使用方法的
内生真菌的鉴定
1501042037(1).png
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97楼2017-07-26 12:11:21
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ytirhjv

新虫 (正式写手)
引用回帖:
98楼: Originally posted by 来至1900 at 2017-08-02 15:06:29
1、提DNA,测ITS序列，在NCBI上比对，上海生工可测序列
2、查阅中国真菌志和其他文献资料，进行形态学鉴定，以形态学鉴定为准。
祝成功

谢谢。

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99楼2017-08-02 15:07:14
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ytirhjv

新虫 (正式写手)
引用回帖:
91楼: Originally posted by 11石宝 at 2017-07-20 09:58:26
我只知道一般细菌和真菌的鉴定方法，不知道对你有没有帮助。首先是分离纯化，确定为单一菌株，然后送去外面公司测16s rDNA系列（上海生工or大连宝生物，我就是送这两个的，好像后者更加精确一点，但是价格贵），得到 ...

小宝石，在不在，咨询哇。

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100楼2017-09-20 10:14:52
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cheng09202楼
2017-07-19 21:35   回复  
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strabarry90楼
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路灯ing94楼
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一叶知秋36596楼
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