应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ?
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 6616  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ? 已有1人参与

如题，请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-07-15 20:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

您好，我也是做ssr，想用genalex软件，但是不知道该软件该如何统计ssr格式？我是按基因型统计的，可是软件没有这种输入格式呢，求解答，谢谢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2018-01-12 20:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多态高低，计算公式如下：
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中：Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率，n为等位基因数。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-07-15 21:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多 ...

谢谢，想用 GenAlEx ~
赞一下 回复此楼
3楼2017-07-15 21:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

那很简单啊，直接软件就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
4楼2017-07-15 22:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +7 李李不服输 2026-03-26 7/350 2026-03-29 16:25 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿华东师范大学有机化学专业，初试351分，复试被刷求调剂! +3 真名有冰 2026-03-29 4/200 2026-03-29 08:47 by qingfeng258
[考研] 11408软件工程求调剂 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 21:50 by zhq0425
[考研] 311求调剂 +9 lin0039 2026-03-26 9/450 2026-03-28 13:05 by 唐沐儿
[考研] 283求调剂 +7 A child 2026-03-28 7/350 2026-03-28 12:05 by zllcz
[考研] 求调剂 +4 零八# 2026-03-27 4/200 2026-03-27 18:07 by yu221
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 考研调剂 +4 Sanmu-124 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 283求调剂（080500） +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 286求调剂 +4 lim0922 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:28 by guoweigw
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 281求调剂 +3 亚克西good 2026-03-26 5/250 2026-03-26 19:48 by 不吃魚的貓
[考研] 中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培 +5 YangTyu1 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:27 by 猫咪猫咪呀
[考研] 材料科学与工程 317求调剂 +4 JKSOIID 2026-03-26 4/200 2026-03-26 15:58 by 不吃魚的貓
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生（材料、化学、电化学，环境） +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭