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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ?
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zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ? 已有1人参与

如题，请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ？
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1楼 2017-07-15 20:33:53
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摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

您好，我也是做ssr，想用genalex软件，但是不知道该软件该如何统计ssr格式？我是按基因型统计的，可是软件没有这种输入格式呢，求解答，谢谢

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6楼2018-01-12 20:36:11
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多态高低，计算公式如下：
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中：Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率，n为等位基因数。
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及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-07-15 21:22:36
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zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多 ...

谢谢，想用 GenAlEx ~
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3楼2017-07-15 21:58:40
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晋鹏

版主 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

那很简单啊，直接软件就可以了。
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及时行乐，人生不留遗憾！
4楼2017-07-15 22:03:17
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查看全部 6 个回答
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