应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ?
61/1返回列表
查看: 6565  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ? 已有1人参与

如题，请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-07-15 20:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多态高低，计算公式如下：
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中：Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率，n为等位基因数。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-07-15 21:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多 ...

谢谢，想用 GenAlEx ~
赞一下 回复此楼
3楼2017-07-15 21:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

那很简单啊，直接软件就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
4楼2017-07-15 22:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 22:03:17
那很简单啊，直接软件就可以了。...

没有找到用 GenAlEx 计算 PIC 的功能在哪里~
赞一下 回复此楼
5楼2017-07-15 22:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

您好，我也是做ssr，想用genalex软件，但是不知道该软件该如何统计ssr格式？我是按基因型统计的，可是软件没有这种输入格式呢，求解答，谢谢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2018-01-12 20:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zmrc 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭