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zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ?已有1人参与

如题,请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ?
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量(polymorphism information content,PIC)。
根据Bostein等(1980)。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标,反映微卫星DNA多态高低,计算公式如下:
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中:Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率,n为等位基因数。
及时行乐,人生不留遗憾!
2楼2017-07-15 21:22:36
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zmrc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量(polymorphism information content,PIC)。
根据Bostein等(1980)。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标,反映微卫星DNA多 ...

谢谢,想用 GenAlEx ~
3楼2017-07-15 21:58:40
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晋鹏

版主 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢,想用 GenAlEx ~...

那很简单啊,直接软件就可以了。
及时行乐,人生不留遗憾!
4楼2017-07-15 22:03:17
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zmrc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 22:03:17
那很简单啊,直接软件就可以了。...

没有找到用 GenAlEx 计算 PIC 的功能在哪里~
5楼2017-07-15 22:28:01
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摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢,想用 GenAlEx ~...

您好,我也是做ssr,想用genalex软件,但是不知道该软件该如何统计ssr格式?我是按基因型统计的,可是软件没有这种输入格式呢,求解答,谢谢

发自小木虫Android客户端
6楼2018-01-12 20:36:11
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