24小时热门版块排行榜    

查看: 6786  |  回复: 5

zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ? 已有1人参与

如题,请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量(polymorphism information content,PIC)。
根据Bostein等(1980)。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标,反映微卫星DNA多态高低,计算公式如下:
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中:Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率,n为等位基因数。
及时行乐,人生不留遗憾!
2楼2017-07-15 21:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量(polymorphism information content,PIC)。
根据Bostein等(1980)。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标,反映微卫星DNA多 ...

谢谢,想用 GenAlEx ~
3楼2017-07-15 21:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢,想用 GenAlEx ~...

那很简单啊,直接软件就可以了。
及时行乐,人生不留遗憾!
4楼2017-07-15 22:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 22:03:17
那很简单啊,直接软件就可以了。...

没有找到用 GenAlEx 计算 PIC 的功能在哪里~
5楼2017-07-15 22:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢,想用 GenAlEx ~...

您好,我也是做ssr,想用genalex软件,但是不知道该软件该如何统计ssr格式?我是按基因型统计的,可是软件没有这种输入格式呢,求解答,谢谢

发自小木虫Android客户端
6楼2018-01-12 20:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zmrc 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +76 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 80/4000 2026-08-14 09:45 by FTtOxlrNccLr
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +14 医学老男孩 2026-08-13 36/1800 2026-08-14 09:41 by 医学老男孩
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +9 Tide man 2026-08-10 10/500 2026-08-13 20:33 by 温淼淼淼
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
信息提示
请填处理意见